Анализ STR

Short T andem R epeat (STR) анализ - распространенный метод молекулярной биологии для сравнение аллельных повторов в конкретных локусах в ДНК между двумя или более образцами. короткий тандемный повтор представляет собой микросателлит с повторяющимися единицами длиной от 2 до 7 пар оснований, причем количество повторов рассматривается у разных людей, что делает STR эффективными для целей идентификации человека. Этот метод отличается от анализа полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (RFLP), поскольку STR-анализ не разрезает ДНК рестрикционными ферментами. Вместо этого используется полимеразная цепная реакция (ПЦР) для определения длин коротких тандемных повторов на основе длины ПЦР.

STR-анализ - это инструмент в судебно-медицинской экспертизе, который оценивает оценки STR-области, обнаруженные в ядерной ДНК. Вариабельная (полиморфная) природа STR-регионов, анализируемые для судебно-медицинской экспертизы, усиливает различение одного профиля ДНК от другого. Научные инструменты, такие как одобренные ФБР, включая эту исследовательскую технику. Судебная медицина использует в своих изменчивости длины STR населения, позволяя ученым отличать один образец ДНК от другого. Используемая сегодня система профилирования ДНК на основе ПЦР и использует простые или короткие тандемные повторы (STR). В этом методе используются высокополиморфные с короткими повторяющимися последовательностями ДНК (чаще всего повторяются 4 основания, но используются другие длины, включая 3 и 5 оснований). Неродственные люди почти наверняка разное количество единиц, STR можно использовать для различения неродственных людей. Эти STR локусы (положения на хромосоме) нацелены с помощью праймеров, специфичных для поставки, и амплифицируются с помощью ПЦР. Получив затем фрагменты ДНК разделяются и детектируются с помощью электрофореза. Существует два распространенных метода разделения и обнаружения: капиллярный электрофорез (CE) и гель-электрофорез.

Каждый STR полиморфен, но количество аллелей очень мало. Обычно каждый аллель STR используется примерно у 5-20% людей. Сила STR-анализа заключается в одновременном рассмотрении нескольких STR-локусов. Набор аллелей позволяет точно идентифицировать человека. Таким образом, анализ STR является отличным способом идентификации. Чем больше STR-области тестируется у человека, тем более разборчивым становится тест.

В разных странах используются разные системы ДНК-профилирования на основе STR. В Северной Америке, где амплифицируют основные локусы CODIS 13, почти универсальны, когда в Америке используется система из 17 локусов (которая совместима с национальной базой данных ДНК ).. Какая бы система ни использовалась, многие из используемых STR-регионов одинаковы. Эти системы ДНК-профилирования основаны на мультиплексных реакциях, которые одновременно используются многими STR-области.

Истинная сила STR-анализа заключается в его статистической способности различать. 13 локусов, которые в настоящее время используются для дискриминации в CODIS, независимо сортируются (наличие определенного количества повторов в одном локусе не изменяет вероятность наличия любого количества локусов в любом другом другом), правило произведения для вероятностей вероятностей локусов в любом другом может шаблон. Это означает, что если у кого-то есть ДНК типа ABC, где три локуса были независимыми, мы можем сказать, что вероятность этого типа ДНК вероятности наличия типа A, умноженная вероятность наличия типа B, умноженная на вероятность наличия типа C. Это привело к возможности генерировать вероятность совпадения 1 в квинтиллионе (1x10) или более. Однако поиск в базе данных ДНК показал гораздо более частые, чем ожидалось, совпадения профилей ДНК. Поскольку на Земле около 12 миллионов монозиготных близнецов, теоретическая вероятность не является точной.

На практике зараженного сопоставления намного выше, чем сопоставления с дальним родственником, например, загрязнение образцов от близлежащих объектов или оставшихся клеток, перенесенных из предыдущего теста. Риск возрастает при сопоставлении с наиболее частым человеком в образцах: все, что было проверено для любых других образцов, доставленных в лабораторию. По этой причине обычно тестируют несколько контрольных образцов, чтобы убедиться, что они оставлены чистыми, если они подготовлены в течение того же периода, что и фактические образцы для испытаний. Неожиданные совпадения (или вариации) в нескольких контрольных образцах высокой вероятности контаминации реальных тестовых образцов. В тесте на родство полные ДНК профили ДНК должны отличаться (за исключением близнецов), доказать, что человек не соответствовал своей собственной ДНК в другом образце.