Политомия

редактировать
Кладограммы B и C содержат политомии, в которых более одной ветви спускается от одного узла.

Внутренний узел Филогенетическое дерево описывается как политомия или мультифуркация, если (i) оно находится в корневом дереве и связано с тремя или более дочерними поддеревьями или (ii) он находится на неукорененном дереве и прикреплен к четырем или более ветвям. Дерево, содержащее любые мультифуркации, можно описать как мультифуркационное дерево.

.

Содержание
  • 1 Мягкие политомии и жесткие политомии
  • 2 Приложения
    • 2.1 Политомии видов
    • 2.2 Молекулярные политомии
  • 3 Распознавание жестких политомий
  • 4 См. Также
  • 5 Ссылки
  • 6 Внешние ссылки
Мягкие политомии против жестких

Различают два типа политомий, мягкие и жесткие политомии.

Мягкие политомии являются результатом недостаточной филогенетической информация: хотя родословные расходились в разное время - а это означает, что некоторые из них являются более близкими родственниками, чем другие, - имеющиеся данные не позволяют распознать это. Большинство политомий являются мягкими, что означает, что они были бы преобразованы в типичное дерево дихотомий, если бы были доступны лучшие данные.

Напротив, жесткая политомия представляет собой событие истинного расхождения трех или более родословные.

Приложения

Интерпретации политомии зависят от индивидов, представленных в филогенетическом дереве.

Политомии видов

Если линии на филогенетическом дереве обозначают виды, политомия показывает одновременное видообразование трех или более видов. В определенных ситуациях они могут быть обычными, например, когда вид, который быстро расширил свой ареал или является высоко панмиктическим, претерпевает перипатрическое видообразование в разных регионах.

Примером может служить комплекс видов Drosophila simulans. Здесь предок, кажется, колонизировал два острова одновременно, но независимо друг от друга, в результате чего образовались два одинаково старых, но дивергентно эволюционировавших дочерних вида

Молекулярные политомии

Если филогенетическое дерево реконструировано из данных последовательностей ДНК В отношении конкретного гена жесткая политомия возникает, когда три или более выбранных гена прослеживают свою родословную до одного гена в предковом организме. Напротив, мягкая политомия проистекает из ветвей на деревьях генов с конечной временной продолжительностью, но для которых не произошло никаких замен.

Распознавание жестких политомий

Поскольку последовательность ДНК эволюция есть обычно намного быстрее, чем эволюция сложных фенотипических признаков, возможно, что генетические линии расходятся на короткое время отдельно друг от друга, в то время как реальный организм не изменился, если вся предковая популяция считается. Поскольку немногие, если вообще какие-либо особи в популяции генетически похожи в какой-либо одной популяции - особенно если сортировка по происхождению не получила широкого распространения - может оказаться, что жесткие политомии действительно редки или вообще отсутствуют, если весь геном каждого отдельного организма считается достаточно широко распространенным на популяционно-генетическом уровне, если целые виды рассматриваются как скрещивающиеся популяции (см. Также концепцию видов ).

«События видообразования или расхождения клонов, происходящие в одно и то же время» относятся к эволюционному времени, измеренному в поколениях, поскольку это единственное средство, что новые признаки (например, зародышевой линии точечные мутации ) могут передаваться. С практической точки зрения способность различать жесткую и мягкую политомии ограничена: если, например, проанализировать килобазу из последовательностей ДНК, которые мутируют примерно на 1% за миллион лет, то клоны расходятся от один и тот же предок в течение тех же 100000 лет не может быть достоверно определен относительно того, кто из них отклонился первым.

Эффекты основателя и генетический дрейф могут привести к разным темпам эволюции. Это может легко запутать алгоритмы молекулярных часов до такой степени, что жесткие политомии станут неузнаваемыми как таковые.

См. Также
Ссылки
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-06-02 10:41:31
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте