MATR3

MATR3
Доступные конструкции PDB Ортолог поиск: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1X4D, 1X4F
Идентификаторы
Псевдонимы	MATR3, ALS21, MPD2, VCPDM, матрин 3
Внешние идентификаторы	OMIM : 164015 MGI : 1298379 HomoloGene : 7830 GeneCards : MATR3
Онтология генов Молекулярная функция • иона цинка связывания • ГО: 0001948 связывания с белками • структурной активности молекулы • связывание иона металла • нуклеиновой кислоты связывания • связывания РНК • идентичную связывания с белками • микроРНК связывания Сотовый компонент • ядерный матрикс • внутренняя мембрана ядра • мембрана • ядро Биологический процесс • посттранскрипционная регуляция экспрессии генов • активация врожденного иммунного ответа • процесс иммунной системы • врожденный иммунный ответ • развитие сердечного клапана • развитие межжелудочковой перегородки Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9782	17184
Ансамбль	ENSG00000015479 ENSG00000280987	ENSMUSG00000037236
UniProt	P43243	Q8K310
RefSeq (мРНК)	NM_001194954 NM_001194955 NM_001194956 NM_001282278 NM_018834 NM_199189	NM_010771
RefSeq (белок)	NP_001181883 NP_001181884 NP_001181885 NP_001269207 NP_061322 NP_954659	NP_034901
Расположение (UCSC)	н / д	н / д
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Matrin-3 представляет собой белок, который у человека кодируется MATR3 гена.

• 1 Функция
• 2 Патология
• 3 ссылки
• 4 Дальнейшее чтение

Белок, кодируемый этим геном, локализован в ядерном матриксе. Он может играть роль в транскрипции или может взаимодействовать с другими белками ядерного матрикса с образованием внутренней фиброгранулярной сети. Для этого гена были идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок.

Мутации в гене Matrin 3 связаны с семейным боковым амиотрофическим склерозом.

• Стурман Н; Meijne AM; ван дер Поль AJ; и другие. (1990). «Ядерный матрикс из клеток разного происхождения. Доказательства общего набора матричных белков». J. Biol. Chem. 265 (10): 5460–5. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (19) 39383-4. PMID   2180926.
• Андерссон Б; Вентланд Массачусетс; Ricafrente JY; и другие. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Biochem. 236 (1): 107–13. DOI : 10.1006 / abio.1996.0138. PMID   8619474.
• Yu W; Андерссон Б; Уорли К.С.; и другие. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. DOI : 10.1101 / gr.7.4.353. PMC   139146. PMID   9110174.
• Окумара К; Ногами М; Matsushima Y; и другие. (1998). «Картирование ДНК-связывающего ядерного белка человека (NP220) на полосу хромосомы 2p13.1-p13.2 и его связь с матрином 3». Biosci. Biotechnol. Biochem. 62 (8): 1640–2. DOI : 10.1271 / bbb.62.1640. PMID   9757574.
• Nagase T; Ishikawa K; Suyama M; и другие. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (5): 277–86. DOI : 10.1093 / dnares / 5.5.277. PMID   9872452.
• Hu RM; Han ZG; Песня HD; и другие. (2000). «Профили экспрессии генов в человеческой оси гипоталамус-гипофиз-надпочечники и клонирование полноразмерной кДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. США. 97 (17): 9543–8. Bibcode : 2000PNAS... 97.9543H. DOI : 10.1073 / pnas.160270997. PMC   16901. PMID   10931946.
• Чжан З., Кармайкл Г.Г. (2001). «Судьба дцРНК в ядре: p54 (nrb) -содержащий комплекс опосредует ядерное удержание произвольно отредактированных A-to-I РНК». Cell. 106 (4): 465–75. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (01) 00466-4. PMID   11525732. S2CID   18799711.
• Бернерт Г., Фунтулакис М., Любец Г. (2003). «Многочисленное снижение уровня белка матрина 3, снижение моторного белка HMP и hlark в мозге плода с синдромом Дауна». Протеомика. 2 (12): 1752–7. DOI : 10.1002 / 1615-9861 (200212) 2:12 lt;:: AID один тысяча семьсот пятьдесят две-PROT1752gt; 3.0.CO 2-Y. PMID   12469345.
• Штраусберг Р.Л.; Feingold EA; Рябчик LH; и другие. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. США. 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899. PMC   139241. PMID   12477932.
• Zhang C; Дауд DR; Staal A; и другие. (2003). «Ядерный коактиватор-62 кДа / Ski-взаимодействующий белок представляет собой коактиватор, связанный с ядерным матриксом, который может связывать опосредованную рецептором витамина D транскрипцию и сплайсинг РНК». J. Biol. Chem. 278 (37): 35325–36. DOI : 10.1074 / jbc.M305191200. PMID   12840015.
• Леонард Д., Аджу П., Ламонд А.И., Легерски Р.Дж. (2003). «hLodestar / HuF2 взаимодействует с CDC5L и участвует в сплайсинге пре-мРНК». Biochem. Биофиз. Res. Commun. 308 (4): 793–801. CiteSeerX   10.1.1.539.8359. DOI : 10.1016 / S0006-291X (03) 01486-4. PMID   12927788.
• Ота Т; Suzuki Y; Nishikawa T; и другие. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285. PMID   14702039.
• Beausoleil SA; Jedrychowski M; Schwartz D; и другие. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. США. 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. DOI : 10.1073 / pnas.0404720101. PMC   514446. PMID   15302935.
• Герхард Д.С. Вагнер Л; Feingold EA; и другие. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504. PMC   528928. PMID   15489334.
• Rual JF; Venkatesan K; Хао Т; и другие. (2005). «К карте протеомного масштаба сети белок-белкового взаимодействия человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R. DOI : 10,1038 / природа04209. PMID   16189514. S2CID   4427026.
• Lim J; Хао Т; Shaw C; и другие. (2006). «Сеть межбелкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Cell. 125 (4): 801–14. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID   16713569. S2CID   13709685.
• Olsen JV; Благоев Б; Gnad F; и другие. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell. 127 (3): 635–48. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID   17081983. S2CID   7827573.
• Юинг Р.М.; Чу П; Elisma F; и другие. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. DOI : 10.1038 / msb4100134. PMC   1847948. PMID   17353931.
• Валенсия, Калифорния, Джу В, Лю Р. (2007). «Матрин 3 представляет собой Ca2 + / кальмодулин-связывающий белок, расщепляемый каспазами». Biochem. Биофиз. Res. Commun. 361 (2): 281–6. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2007.06.156. PMID   17658460.

• v
• т
• е