Общественное здравоохранение в Нигере страдает от хронической нехватки ресурсов и небольшое количество поставщиков медицинских услуг по отношению к населению. Некоторые лекарства в дефиците или недоступны.
Есть государственные больницы в Ниамей (с тремя основными больницами в Ниамее, включая Национальную больницу Ниамея и Национальную больницу Де Ламорде ), Маради, Тахуа, Зиндер и другие крупные города с небольшими медицинскими клиниками в большинстве городов.
Медицинские учреждения ограничены как в запасах, так и в персонале, с небольшой государственной системой здравоохранения, дополняемой частные, благотворительные, религиозные и неправительственные организации управляли клиниками и программами общественного здравоохранения (например, больница Галми около Бирнин Конни и Маради).
Государственные больницы, а также программы общественного здравоохранения, подпадают под действие Контроль Министерства здравоохранения Нигерии. Ряд частных коммерческих клиник ("Cabinets Médical Privé") работает в Ниамее и других городах. Общие расходы на здравоохранение на душу населения в 2005 г. составили 25 международных долларов. В 2004 году в Нигере было 377 врачей, соотношение 0,03 на 10 000 населения. В 2003 году 89,2% индивидуальных расходов на здравоохранение были «наличными» (оплачивались пациентом).
Малярия остается основным проблема общественного здравоохранения и эндемична по всей стране. В качестве основной причины болезней в Нигере малярия составляет 28 процентов всех болезней и 50 процентов всех зарегистрированных смертей. На детей в возрасте до пяти лет приходится около 62 процентов бремени болезней и 75 процентов смертности от малярии. В 2015 году Нигер ввел в действие национальную политику в области здравоохранения, направленную на повышение справедливости услуг и качества ухода за счет расширения доступа к медицинским услугам для уязвимых групп населения, таких как женщины, дети, инвалиды и сельское население, а также освобожденных матерей и детей в возрасте до пяти лет.
NMCP сосредоточила свои усилия на снижении бремени заболеваемости и смертности от малярии за счет систематического использования диагностических инструментов для подозреваемых случаев малярии и эффективного использования противомалярийных препаратов для подтвержденных случаев. Программа Нигера по борьбе с малярией также поддерживает стратегии профилактики, такие как профилактика малярии во время беременности, массовое распространение лекарств для сезонной профилактики малярии и меры по борьбе с переносчиками инфекции, включая содействие последовательному использованию сеток, обработанных инсектицидами длительного пользования.
Полиомиелит, еще в 2000 году считавшийся местным эндемичным, ежегодно регистрируется в небольшом количестве случаев, в основном завозных из северной Нигерии, где в 2005 году проживало около 40 процентов подтвержденных случаев заболевания в мире.
Нигер находится в поясе Африки к югу от Сахары, подверженной сезонным вспышкам Neisseria meningitidis : менингококкового бактериального менингита. Эти вспышки, как правило, происходят в конце «холодного» сезона (температура опускается до 15 градусов по Цельсию (59 градусов по Фаренгейту) ночью в некоторых районах) в феврале и в начале сезона дождей в мае. Вспышка менингита в Западной Африке в 2009 г. привела к нескольким тысячам инфекций и более чем 100 смертельным исходам.
Вспышки кори все еще происходят в Нигере, отчасти из-за низкого уровень вакцинации и частично из-за сезонной миграции сельского населения. Было обнаружено, что спорадические вспышки в общинах Нигерии начинались в конце сезона дождей, когда многие сельские жители начинают сезонную миграцию, когда путешествующие дети часто пропускают свою жизненно важную вторую бустерную иммунизацию против этой болезни.
По оценкам 2008 г., от 44 000 до 85 000 человек, живущих с ВИЧ, в стране с населением около 14 миллионов человек, при этом показатель распространенности среди взрослого населения (в возрасте от 15 до 49 лет) составляет от 0,6% до 1,1%. Взрослые в возрасте 15 лет и старше, живущие с ВИЧ, оцениваются в диапазоне от 42 000 до 81 000, при этом женщины этого возрастного диапазона составляют примерно треть (от 12 000 до 26 000). По оценкам, число детей (до 14 лет), живущих с ВИЧ, составляло от 2 500 до 4 200 человек. По оценкам, общее количество смертей составляло от 3000 до 5600 в год. Сироты из-за СПИДа (младше 17 лет) оценивались в 18 000–39 000 человек.
Уровень материнской смертности на 100 000 рождений в Нигере в 2010 г. составил 820. Это по сравнению с 600,7 в 2008 году и 890,1 в 1990 году. Коэффициент смертности детей в возрасте до 5 лет на 1000 рождений составляет 167, а неонатальная смертность в процентах от смертности детей в возрасте до 5 лет составляет 22. В Нигере количество акушерок на 1000 живорождений составляет 1, а пожизненный риск смерти для беременных составляет 1 из 16.
19 марта был зарегистрирован первый случай COVID-19 в стране. подтверждено в Ниамее.