Death fold

редактировать

Структура белка домена смерти. 1ngr

складка смерти - это мотив третичной структуры , обычно встречающийся в белках, участвующих в апоптозе или процессы, связанные с воспалением. Этот мотив обычно встречается в доменах, которые участвуют в межбелковых взаимодействиях, ведущих к образованию больших функциональных комплексов. Примеры доменов «складки смерти» включают домен смерти (DD), эффекторный домен смерти (DED), домен рекрутирования каспаз (CARD) и пирин. домен (PYD).

Домены гибкой складки представляют собой эволюционно консервативное суперсемейство доменов, которые опосредуют передачу сигналов апоптоза. Два типа апоптоза, внешний и внутренний, жестко регулируются взаимодействием активирующих и тормозных путей. Взаимодействия между четырьмя различными мотивами складки смерти являются объединяющим механизмом в обоих типах апоптоза.

Содержание
  • 1 Структура
  • 2 Четыре домена гибкой складки
  • 3 Связывание и взаимодействия
  • 4 Ссылки
Структура

Существует большая разница в первичной аминокислоте последовательность четырех различных мотивов гибельной складки, но каждый имеет аналогичную трехмерную структуру. Мотивы «складки смерти» характеризуются от шести до семи плотно скрученных альфа-спиралей, образующих складку «греческого ключа». Мотивы состоят из нескольких определенных белковых взаимодействий с другими предполагаемыми апоптотическими ролями (Лам).

Четыре домена складки смерти

Домен рекрутирования каспаз (CARD) CARD-содержащие белки обнаружены во всем животном мире и могут также присутствовать в грибах, растениях и прокариотах. Домены CARD присутствуют на прокаспазах млекопитающих и выполняют функции в апоптозе, процессинге цитокинов, иммунной защите и активации NF-κB. У насекомых и нематод использование CARD пока что ограничивается апоптотическими белками.

Домен смерти (DD) DD обнаруживаются в основном у позвоночных (хотя они также присутствуют у некоторых других животных). DD содержатся на рецепторах цитокинов в семействе рецепторов TNF. Белки DD участвуют в апоптозе и передаче сигналов NF-κB у млекопитающих, но только Drosophila, передающих сигналы NF-κB.

эффекторный домен смерти (DED) DED присутствуют на каспазах и участвуют в активации каспаз. DED-содержащие каспазы участвуют в апоптозе, индуцированном рецептором смерти, у млекопитающих, но отличаются у насекомых, поскольку они участвуют в передаче сигналов NF-κB и антибактериальных ответах.

ПИРИН ПИРИНЫ являются наиболее недавно обнаруженным доменом «складки смерти», и их функции и взаимодействия еще не выяснены.

Связывание и взаимодействия

Смертельная складка мотивов, как полагают, проявляет свои эффекты исключительно через моновалентные взаимодействия. В этих взаимодействиях складки смерти связываются с другой складкой смерти, содержащей домен, через домен взаимодействия того же типа с белками. Эти взаимодействия высокоспецифичны, и нет известных взаимодействий между различными типами гибких доменов - во всех известных случаях есть партнеры по связыванию (DD-DD, CARD-CARD, DED-DED). Считается, что роль этих гомотипических взаимодействий заключается в самосборке (Лам). Это приводит к образованию больших многосубъединичных структур, состоящих только из одного типа белка.

Ссылки
Последняя правка сделана 2021-05-17 10:04:13
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте