Семейство передачи генов, усиленных семенниками

редактировать
Семейство транскриптов генов, усиленных семенниками
Идентификаторы
СимволTEGT
Pfam PF01027
TCDB 1.A.14
Надсемейство OPM 703
белок OPM 4pgr

Семейство генов, усиленных семенниками (TEGT), включает протеины транскриптов генов, усиленных семенниками, у млекопитающих, которые экспрессируются на высоком уровне в семенники, предполагаемые глутамат / аспартат-связывающие белки растений и животных, белок YccA Escherichia coli и белок YetJ Bacillus subtilis. Эти белки имеют длину около 200-250 остатков и демонстрируют 7 ТМС.

Содержание
  • 1 Гомология
  • 2 BI-1
  • 3 Функция
  • 4 Структура
  • 5 Транспортная реакция
  • 6 Ссылки
Гомология

Гомологи обнаружены у множества грамотрицательных и грамположительных бактерий, дрожжей, грибов, растений, животных и вирусов. Геном E. coli кодирует три паралога: YbhL, YbhM и YccA. Отдаленные гомологи, обнаруженные у Drosophilia melanogaster и крысы, представляют собой белок, связанный с рецептором N-метил-D-аспартата (NMDARAI), и глутамат-связывающую цепь рецептора N-метил-D-аспартата, соответственно. Двумя другими являются белок нервной мембраны крысы 35 и белок Arabidopsis thaliana Bax-ингибитор-1 (BI-1), способный подавлять индуцированную Bax гибель клеток в дрожжах.

BI-1

Один из этих белков, TEGT или Bax Inhibitor-1 (TC # 1.A.14.1.1 ), имеет C-концевой домен, который формирует Ca-проницаемый канал. BI-1 представляет собой белок, локализованный в ER, который защищает от апоптоза и стресса ER. Предполагается, что BI-1 модулирует гомеостаз ER Ca , действуя как канал утечки Ca. Эти белки отдаленно связаны с ионотропным глутамат-связывающим белком рецептора N-метил-D-аспартата (NMDA) человека. Гомологи включают предполагаемый белок, индуцируемый холодовым шоком, и белок, стабилизирующий SecY.

Функция

На основании экспериментального определения топологии BI-1 Bultynck et al. предполагает, что его C-концевой α-спиральный пептид из 20 аминокислот катализирует поток Са как in vivo, так и in vitro. Свойства утечки кальция были сохранены среди ортологов животных, но не растений и дрожжей. Мутировав один из критических остатков аспартата (D 213) в предлагаемой поре Са-канала в полноразмерном BI-1, D 213 оказался важным для зависимого от BI-1 ER Ca-утечка.

Структура

Chang et al. опубликовали кристаллические структуры бактериального гомолога, ЙетJ (TC # 1.A.14.2.3 ) с разрешением 1,9 Å и охарактеризовали его активность по утечке кальция. Его складка из семи трансмембранных спиралей состоит из двух сэндвичей с тройной спиралью, обернутых вокруг центральной С-концевой спирали. Структуры, полученные в закрытой и открытой конформации, обратимо взаимопревращаемы при изменении pH. Связанная водородными связями нарушенная пара консервативных аспартильных остатков объясняет зависимость этого перехода от pH, а pH регулирует приток кальция в протеолипосомы. Гомологические модели человеческого BI-1 позволили понять его цитопротекторную активность.

Транспортная реакция

Обобщенная реакция, катализируемая каналами TEGT, следующая:

катионы (выходят) ⇌ катионы (в)
Ссылки

На данный момент в этой статье используется контент из «1.A.14 Семейство улучшенной передачи генов яичек (TEGT)», которое лицензировано таким образом, чтобы разрешить повторное использование под непортированной лицензией Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0, но не под GFDL. Все соответствующие условия должны быть соблюдены.

Последняя правка сделана 2021-06-10 02:38:11
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте