Семейство транскриптов генов, усиленных семенниками | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||
Символ | TEGT | ||||||||
Pfam | PF01027 | ||||||||
TCDB | 1.A.14 | ||||||||
Надсемейство OPM | 703 | ||||||||
белок OPM | 4pgr | ||||||||
|
Семейство генов, усиленных семенниками (TEGT), включает протеины транскриптов генов, усиленных семенниками, у млекопитающих, которые экспрессируются на высоком уровне в семенники, предполагаемые глутамат / аспартат-связывающие белки растений и животных, белок YccA Escherichia coli и белок YetJ Bacillus subtilis. Эти белки имеют длину около 200-250 остатков и демонстрируют 7 ТМС.
Гомологи обнаружены у множества грамотрицательных и грамположительных бактерий, дрожжей, грибов, растений, животных и вирусов. Геном E. coli кодирует три паралога: YbhL, YbhM и YccA. Отдаленные гомологи, обнаруженные у Drosophilia melanogaster и крысы, представляют собой белок, связанный с рецептором N-метил-D-аспартата (NMDARAI), и глутамат-связывающую цепь рецептора N-метил-D-аспартата, соответственно. Двумя другими являются белок нервной мембраны крысы 35 и белок Arabidopsis thaliana Bax-ингибитор-1 (BI-1), способный подавлять индуцированную Bax гибель клеток в дрожжах.
Один из этих белков, TEGT или Bax Inhibitor-1 (TC # 1.A.14.1.1 ), имеет C-концевой домен, который формирует Ca-проницаемый канал. BI-1 представляет собой белок, локализованный в ER, который защищает от апоптоза и стресса ER. Предполагается, что BI-1 модулирует гомеостаз ER Ca , действуя как канал утечки Ca. Эти белки отдаленно связаны с ионотропным глутамат-связывающим белком рецептора N-метил-D-аспартата (NMDA) человека. Гомологи включают предполагаемый белок, индуцируемый холодовым шоком, и белок, стабилизирующий SecY.
На основании экспериментального определения топологии BI-1 Bultynck et al. предполагает, что его C-концевой α-спиральный пептид из 20 аминокислот катализирует поток Са как in vivo, так и in vitro. Свойства утечки кальция были сохранены среди ортологов животных, но не растений и дрожжей. Мутировав один из критических остатков аспартата (D 213) в предлагаемой поре Са-канала в полноразмерном BI-1, D 213 оказался важным для зависимого от BI-1 ER Ca-утечка.
Chang et al. опубликовали кристаллические структуры бактериального гомолога, ЙетJ (TC # 1.A.14.2.3 ) с разрешением 1,9 Å и охарактеризовали его активность по утечке кальция. Его складка из семи трансмембранных спиралей состоит из двух сэндвичей с тройной спиралью, обернутых вокруг центральной С-концевой спирали. Структуры, полученные в закрытой и открытой конформации, обратимо взаимопревращаемы при изменении pH. Связанная водородными связями нарушенная пара консервативных аспартильных остатков объясняет зависимость этого перехода от pH, а pH регулирует приток кальция в протеолипосомы. Гомологические модели человеческого BI-1 позволили понять его цитопротекторную активность.
Обобщенная реакция, катализируемая каналами TEGT, следующая:
На данный момент в этой статье используется контент из «1.A.14 Семейство улучшенной передачи генов яичек (TEGT)», которое лицензировано таким образом, чтобы разрешить повторное использование под непортированной лицензией Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0, но не под GFDL. Все соответствующие условия должны быть соблюдены.