Сайты сегрегации - это позиции, которые показывают различия (полиморфизмы ) между родственными генами в выравнивании последовательностей (не консервативны ). Сайты сегрегации включают консервативные, полуконсервативные и неконсервативные мутации.
Доля сегрегационных сайтов в гене является важной статистикой в популяционной генетике, поскольку ее можно использовать для оценки частоты мутаций при отсутствии отбора. Например, он используется для расчета нейтральной статистики эволюции Таджимы D.
A выравнивание последовательностей, продуцируемое ClustalO, белков гистонов млекопитающих.. Последовательности представляют собой аминокислоты для остатков 120-180 белков. Остатки, которые сохраняются во всех последовательностях, выделены серым цветом. Ниже белковых последовательностей находится ключ, обозначающий консервативную последовательность (*), консервативные мутации (:), полуконсервативные мутации (.) И неконсервативные мутации ()..