Префолдин - это семейство белков, используемых в комплексах сворачивания белков. Классифицируется как гетерогексамерный молекулярный шаперон у архей и эукариев, включая людей. Молекула префолдина работает как переносящий белок в сочетании с молекулой шаперонина для образования шаперонного комплекса и правильной укладки других растущих белков.Одно из основных применений префолдина у эукарий - образование молекул актина для использования в эукариотическом цитоскелете.
Префолдин - одно из семейств шаперонных белков обнаруженных в доменах эукарий и архей. Префолдин действует в комбинации с другими молекулами, способствуя сворачиванию белков в клетках, где существует множество других конкурирующих путей сворачивания. Белки-шапероны выполняют нековалентную сборку других полипептид-содержащих st разломы in vivo. Они участвуют в сворачивании большинства других белков.
Предполагается, что в архее префолдины действуют в комбинации с шаперонинами группы II в сворачивании белка de novo . Однако у эукарий префолдины приобрели более специфическую функцию: они используются для установления правильной сборки канальцев для многих канальцевых белков, таких как актин. Актин составляет 5–10% всего белка, обнаруженного в эукариотических клетках, что означает, что префолдин довольно широко распространен в клетках. Актин состоит из двух ниток бусинок, намотанных друг на друга, и является одной из трех основных частей цитоскелета эукариотических клеток. Префолдин связывается специфически с цитозольным белком-шаперонином. Этот комплекс префолдина и шаперонина затем образует молекулы актина в цитозоле. Префолдин действует как молекула-переносчик, которая переносит связанные, развернутые целевые белки к молекуле шаперонина (C-CPN).
Например, префолдин, который используется при образовании актина, также переносит α или β тубулин в цитозольный шаперонин. Однако префолдин не образует тройного комплекса с тубулином и шаперонином. Как только тубулины вступают в контакт с шаперонином, префолдин автоматически отпускает и покидает активный сайт из-за его высокого сродства к молекуле шаперонина. Как только префолдин входит в контакт с белком-шаперонином, он теряет сродство к развернутому белку-мишени.
Префолдин активируется только для связывания с неродными белками-мишенями в цитозоле, так что он будет связываться только с развернутыми белками. В отличие от многих других молекулярных шаперонов, префолдин не использует химическую энергию в форме аденозинтрифосфата (АТФ), чтобы способствовать сворачиванию белка.
Был обнаружен префолдин. лабораторией Николаса Дж. Коуэна с факультета биохимии Медицинского центра Нью-Йоркского университета. Это было обнаружено с помощью хроматографии. Развернутый меченый β-актин из семенников крупного рогатого скота помещали в раствор. Этот раствор содержал избыток цитозольного шаперонина (C-CPN), эукариотического белка шаперона, необходимого для укладки актина. После гель-фильтрации актина начал формироваться комплекс актина, состоящий из актина и связанных с ним белков, и наблюдали молекулярную массу комплекса. Гель-электрофорез использовали для анализа белкового комплекса, комплекс образовывал единственную полосу, которую вырезали и наносили на гель SDS. Он разделился на пять полос, что доказывает, что гетероолигомерный белок используется для связывания с развернутым актином. Статья об открытии была опубликована 29 мая 1998 года в журнале Cell.
Лаборатория Ульриха Хартла в Институте биохимии Макса Планка в Мартинсриде, Германия, идентифицировала архейного гомолога префолдина, который также функционирует как молекулярный шаперон. Эукариотический префолдин, вероятно, произошел от архей, поскольку он не присутствует (или был утрачен) из бактерий.
Префолдин представляет собой гетерогексамерный белок, состоящий из двух субъединиц α и четырех субъединиц β. Структура гомолога архей была впервые решена Зигертом и др. Другая структура префолдина архей была затем опубликована Кларком и др. Бета-субъединицы содержат 120 аминокислотных остатков каждая, в то время как субъединицы α содержат 140 аминокислотные остатки каждый. У архей Methanococcus thermoautrophicum ширина каждой субъединицы составила 8,4 нм. Расчетная высота составляла 1,8-2,6 нм. Субъединицы расположены за счет гидрофобных взаимодействий с двумя β-барабанами в центре и спиральными спиралями α, выступающими из них, как если бы это была медуза.