Войти
| Питовирус | |
|---|---|
 | |
| Классификация вирусов | |
| Группа: | Группа I (дцДНК ) |
| Порядок : | Megavirales |
| Семейство: | Pithoviridae |
| Род: | Pithovirus |
| Вид | |
| |
Pithovirus, впервые описанный в статье 2014 г., это род гигантского вируса, известного от одного вида, Pithovirus sibericum, который заражает амебы. Это двойной -цепочечный ДНК-вирус и является членом нуклеоцитоплазматических больших ДНК-вирусов клада. Открытие 2014 года было сделано, когда жизнеспособный образец был найден у 30 000-летнего ледяной керн извлечен из вечной мерзлоты в Сибири, Россия.
Название рода Pithovirus, отсылка к большим хранилищам древней Греции, известным как pithoi, был выбран для описания нового вида. Образец питовируса имеет размеры приблизительно 1,5 мкм (1500 нм ) в длину и 0,5 мкм (500 нм) в диаметре, что делает его самым крупным вирусом, который когда-либо был обнаружен. Он на 50% больше по размеру, чем Pandoraviridae, предыдущие самые известные вирусы, больше, чем Ostreococcus, самая маленькая эукариотическая клетка, хотя Pandoravirus имеет самый большой вирусный геном, содержащий от 1,9 до 2,5 мегабаз ДНК.
Питовирус имеет толстую овальную стенку с отверстием на одном конце. Внутренне его структура напоминает соты.
. Геном питовируса содержит 467 различных генов, что больше, чем у обычного вируса, но гораздо меньше, чем 2556 предполагаемых кодирующих белок последовательностей. найдено в Pandoravirus. Таким образом, его геном гораздо менее плотно упакован, чем любой другой известный вирус. Две трети его белков не похожи на белки других вирусов. Несмотря на физическое сходство с Pandoravirus, последовательность генома Pithovirus показывает, что он едва ли связан с этим вирусом, но больше напоминает представителей Marseilleviridae, Megaviridae и Iridoviridae. Все эти семейства содержат большие икосаэдрические вирусы с ДНК-геномами. Геном питовируса имеет 36% GC-содержание, аналогично Megaviridae, в отличие от более 61% для пандоровирусов.
геном питовируса представляет собой одну кольцевую хромосому с двухцепочечной ДНК (дцДНК ) примерно из 610 000 пар оснований (п.н.), кодирующую примерно 467 открытых рамок считывания (ORFs), что переводится в 467 различных белков. Геном кодирует все белки, необходимые для производства мРНК ; эти белки присутствуют в очищенных вирионах. Таким образом, питовирус проходит полный цикл репликации в цитоплазме своего хозяина, а не более типичному методу захвата ядра хозяина.
Pithovirus sibericum был обнаружен в Образец сибирской вечной мерзлоты возрастом 30 000 лет, сделанный Шанталь Абергель и Жан-Мишелем Клавери из Университета Экс-Марсель. Вирус был обнаружен погребенным на 30 м (100 футов) ниже поверхности отложений позднего плейстоцена. Он был обнаружен, когда образцы, собранные на берегу реки в 2000 году, подверглись воздействию амеб. Амебы начали умирать, и при осмотре были обнаружены гигантские образцы вируса. Авторы заявили, что идея исследовать образцы вечной мерзлоты на предмет новых вирусов появилась после того, как они прочитали об эксперименте, в котором двумя годами ранее были возрождены семена Silene stenophylla схожей выдержки. Результаты исследования питовируса были опубликованы в Proceedings of the National Academy of Sciences в марте 2014 года. Хотя вирус безвреден для человека, его жизнеспособность после тысячелетнего замораживания вызвала обеспокоенность в связи с глобальным изменением климата и бурение в тундре может привести к обнаружению ранее не обнаруженных и потенциально патогенных вирусов. Однако другие ученые оспаривают, что этот сценарий представляет реальную угрозу.
Современный вид этого рода, Pithovirus massiliensis, был выделен в 2016 году. Основные особенности, такие как порядок ORF и сиротских генов (ORFans) хорошо законсервированы между двумя известными видами.
Скорость мутации генома, по оценкам, составляет 2,23 × 10 замен на сайт /год. Авторы предположили, что эти вирусы возникли по крайней мере сотни тысяч лет назад.
Портал вирусов 