Войти
Повтор NHL, содержащий белок 2, или NHLRC2, представляет собой белок, кодируемый геном NHLRC2.
NHLRC2 также упоминается как новый повторяющийся домен NHL, содержащий белок, и 1200003F01Rik.
NHLRC2 расположен на положительной цепи хромосома 10, в положении 10q25.3. Полный ген охватывает 62 533 пары оснований (п.н.). Одиннадцать экзонов транскрибируются в мРНК, кодирующей белок. Существует второй, менее распространенный вариант транскрипции NHLRC2; эта некодирующая изоформа составляет 522 п.н. сохраненного интрона.
Транслируемый белок NHLRC2 имеет длину 726 аминокислот у человека и имеет молекулярную массу 79 442,59 г / моль. Он был обнаружен в цитозоле, митохондриях и / или пероксисомах клеток, в которых он экспрессируется.
NHLRC2 является частью NHL-repeat суперсемейство n-лопастных бета-винтов. В частности, NHLRC2 - это 6-лопастной бета-винт. Повтор NHL обнаружен во многих эукариотических и прокариотических белках и связан с регуляторами фактора роста.
Функция NHLRC2 еще полностью не изучена. Используя биоинформатический анализ, было обнаружено, что мотив "YVAD" сохраняется у эукариот, бактерий и архей. «YVAD» трижды обнаруживается отдельно в белке NHLRC2 человека. Этот мотив потенциально участвует в ингибировании каспаз 1, 2, 3, 4 5, таким образом, возможно, обладает антиапоптотическими свойствами.
Согласно NCBI GEO паттерны экспрессии микроматрицы, а также профили экспрессируемой последовательности (EST) UniGene, NHLRC2 экспрессируется на низких уровнях в большинстве тканей человека.
NCBI GEO Profiles подробно описывает несколько условий, при которых экспрессия NHLRC2 увеличивается по сравнению с базовыми уровнями экспрессии. Многие, но не все, условные случаи связаны с увеличением экспрессии NHLRC2 при различных типах рака, включая, помимо прочего, следующие: лейкоз, лимфомы, рак груди и молочной железы, колоректальный рак, опухоль Вильмса и рак легких.
NHLRC2 не имеет человеческих паралогов. Однако обширные ортологи были идентифицированы с помощью программ NCBI BLAST и BLAT. Отдельная группа ортологов подробно описана в таблице ниже. Это не исчерпывающий список ортологов; скорее, это показывает разнообразие ортологов NHLRC2.
PSORT II предсказал один возможный сайт расщепления в пределах NHLRC2 у человека: между аминокислотами 32Q и 33E. PSORT II также предсказал два возможных вакуолярных сигнальных мотива - KLPK и TLPK - у людей, которые также сохраняются у близких ортологов, таких как позвоночные и амфибии, но не у далеких ортологов, таких как насекомые или растения.
