Войти
| Myoviridae | |
|---|---|
 | |
| ТЕМ- изображение вириона Synechococcus Phage S-PM2 | |
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Царство: | Дуплоднавирия |
| Королевство: | Heunggongvirae |
| Тип: | Уровирикота |
| Класс: | Caudoviricetes |
| Порядок: | Caudovirales |
| Семья: | Myoviridae |
| Подсемейства и роды | |
| см текст | |
Myoviridae - это семейство бактериофагов отряда Caudovirales. Бактерии и археи служат естественными хозяевами. В этом семействе 625 видов, отнесенных к восьми подсемействам и 217 родам.
Подсемейство Tevenvirinae (синоним: Tequatrovirinae) названо в честь его типового вида фага Enterobacteria T4. Члены этого подсемейства морфологически неотличимы и имеют умеренно удлиненные головы длиной около 110 нанометров (нм), длинные хвосты 114 нм с воротником, базовые пластины с короткими шипами и шесть длинных изогнутых хвостовых волокон. Роды этого подсемейства делятся на основе морфологии головы: у рода Tequatrovirus (предварительное название: T4virus) длина головы составляет 137 нм, а у представителей рода Schizot4virus длина головы составляет 111 нм. Внутри родов на основе гомологии белков виды были разделены на несколько групп.
Подсемейство Peduovirinae имеет вирионы с диаметром головы 60 нм и хвостом 135 × 18 нм. Эти фаги легко идентифицировать, потому что сжатые оболочки имеют тенденцию соскальзывать с ядра хвоста. Фаг P "является типовым видом.
Подсемейство Spounavirinae - это вирулентные фаги с широким спектром хозяев, которые инфицируют представителей Firmicutes. Они обладают изометрическими головками диаметром 87-94 нм и заметными капсомерами, полосатыми хвостами длиной 140-219 нм и двойной базовой пластиной. На кончике хвоста имеются шаровидные структуры, которые, как сейчас известно, представляют собой шипы базовой пластинки и короткие изогнутые волокна хвоста с шестикратной симметрией. Члены этой группы обычно обладают большими (127–142 т.п.н.) неперестановочными геномами с концевой избыточностью 3,1–20 т.п.н. Название этого подсемейства происходит от SPO plus una (латинское для одного).
Галовирусы HF1 и HF2 принадлежат к одному роду, но, поскольку они инфицируют архей, а не бактерии, вероятно, будут помещены в отдельный род после того, как будет определена их классификация.
Группа карликов была предложена на морфологических и геномных основаниях. В эту группу входят фаги Aeromonas salmonicida 56, фаги Vibrio cholerae 138 и CP-T1, фаг Bdellovibrio φ1422 и фаг Pectobacterium carotovorum ZF40. Их общие характеристики включают идентичную морфологию вирионов, характеризующуюся обычно короткими сократительными хвостами, и все они имеют размер генома приблизительно 45 килобаз. Порядок генов в структурной единице генома следующий: терминаза - портал - голова - хвост - базовая пластинка - волокна хвоста.
Типичная структура миовируса Вирусы Myoviridae не имеют оболочки, имеют форму голова-хвост (с шеей). Геномы представляют собой линейную двухцепочечную ДНК длиной около 33–244 килобайт. Геном кодирует от 40 до 415 белков. Он имеет окончательно повторяющиеся последовательности. Содержание GC ~ 35%. Геном кодирует 200–300 белков, которые транскрибируются в оперонах. В геноме может присутствовать 5-гидроксиметилцитозин (вместо тимидина ).
Трубчатый хвост имеет спиральную симметрию и имеет диаметр 16-20 нм. Он состоит из центральной трубки, сократительной оболочки, воротника, опорной пластины, шести хвостовых штифтов и шести длинных волокон. Он похож на Tectiviridae, но отличается тем, что хвост миовируса является постоянным.
Для сокращения хвоста требуется АТФ. При сокращении оболочки субъединицы оболочки скользят друг по другу и хвост укорачивается до 10-15 нм в длину.
Цикл размножения бактериофага Pseudomonas PAK_P3, род Nankokuvirus 
Микрофотография пластикового тонкого среза клетки сальмонеллы с капсидами Phage SPN3US, выстроенными на клеточной мембране. Масштабная линейка: 2000 Å. Предоставлено: Дж. Бернард Хейманн и др. (2020) Прикрепляясь к клетке-хозяину, вирус использует свою сократительную оболочку как шприц, прокалывая стенку клетки своей центральной трубкой и вводя генетический материал в хозяина. Введенная ДНК берет на себя механизмы транскрипции и трансляции клетки-хозяина и начинает производить новые вирусы. Репликация следует модели репликативной транспозиции. Транскрипция с использованием ДНК-шаблона - это метод транскрипции. Трансляция происходит за счет сдвига рамки рибосомы на -1. Вирус покидает клетку-хозяина путем лизиса и белков холина / эндолизина / спанина. Бактерии и археи служат естественным хозяином. Путь передачи - пассивное распространение.
Хотя миовирусы в целом литические, у них отсутствуют гены, необходимые для того, чтобы стать лизогенными, известен ряд видов умеренного климата.
Поскольку большинство Myoviridae являются литическими, а не умеренными фагами, некоторые исследователи исследовали их использование в качестве терапии бактериальных заболеваний у людей и других животных.
Различают следующие восемь подсемейств:
Кроме того, следующие роды не относятся к подсемейству:
