Войти
Элемент вставки (также известный как IS, элемент последовательности вставки или элемент IS ) представляет собой короткую последовательность ДНК, которая действует как простой мобильный элемент. Последовательности вставки имеют две основные характеристики: они малы по сравнению с другими мобильными элементами (обычно в длину от 700 до 2500 bp ) и кодируют только белки, участвующие в активности транспозиции (они таким образом отличается от других транспозонов, которые также несут вспомогательные гены, такие как гены устойчивости к антибиотикам ). Эти белки обычно представляют собой транспозазу, которая катализирует ферментативную реакцию, позволяющую перемещаться IS, а также один регуляторный белок, который либо стимулирует, либо ингибирует активность транспозиции. Кодирующая область в инсерционной последовательности обычно фланкируется инвертированными повторами. Например, хорошо известный IS911 (1250 п.н.) фланкирован двумя конечностями инвертированного повтора по 36 п.н., а кодирующая область имеет два гена, частично перекрывающихся orfA и orfAB, кодирующих транспозазу (OrfAB) и регуляторный белок (OrfA). Конкретная последовательность вставки может быть названа в соответствии с формой ISn, где n - число (например, IS1, IS2, IS3, IS10, IS50, IS911, IS26 и т. Д.); Однако это не единственная используемая схема именования. Хотя инсерционные последовательности обычно обсуждаются в контексте геномов прокариот , некоторые последовательности эукариот ДНК, принадлежащие семейству мобильных элементов Tc1 / mariner, можно рассматривать как - последовательности вставки.
Диаграмма, иллюстрирующая роль последовательностей вставки («IS») в составном транспозоне В дополнение к автономному возникновению последовательности вставки могут также встречаться как части составных транспозонов ; в составном транспозоне две последовательности вставки фланкируют один или несколько дополнительных генов, таких как ген устойчивости к антибиотикам (например, Tn10, Tn5). Тем не менее, существует другой вид транспозонов, называемых единичными транспозонами, которые не несут инсерционные последовательности на своих концах (например, Tn7).
Сложный транспозон не зависит от фланкирующих последовательностей вставки для резольвазы. Резольваза является частью генома tns и разрезает фланкирующие инвертированные повторы.
Частота транспозиции IS-элементов зависит от множества параметров, включая фазу роста культуры, состав среды, напряжение кислорода, масштаб роста и структурную конформацию целевых сайтов (например, кривизну, присутствие определенных мотивов, состав ДНК).
