Cys-loop лиганд-управляемый ионный канал суперсемейство состоит из никотинового ацетилхолина, ГАМК A, ГАМК A-ρ, рецепторы глицина, 5-HT 3 и цинк-активированные (ZAC) рецепторы. Эти рецепторы состоят из пяти белковых субъединиц, которые образуют пентамерную структуру вокруг центральной поры. Обычно существует 2 альфа-субъединицы и 3 других бета, гамма или дельта-субъединицы (некоторые состоят из 5 альфа-субъединиц). Название семейства относится к характерной петле, образованной 13 высококонсервативными аминокислотами между двумя остатками цистеина (Cys), которые образуют дисульфидную связь рядом с N-концевой внеклеточный домен.
Рецепторы Cys-петли известны только у эукариот, но являются частью более крупного семейства ионных каналов, управляемых пентамерным лигандом. Только кладка Cys-петли включает пару мостиковых остатков цистеина. Более крупное суперсемейство включает бактериальные (например, GLIC ), а также эукариотические рецепторы без петли Cys, и называется «ионными каналами, управляемыми пентамерным лигандом», или «рецепторами про-петли».
Все субъединицы состоят из большого консервативного внеклеточного N-концевого домена, трех высококонсервативных трансмембранных доменов, цитоплазматической петли переменного размера и аминокислотной последовательности и четвертой трансмембранной области с относительно коротким и вариабельным внеклеточным C-концевым доменом.. Нейротрансмиттеры связываются на границе раздела между субъединицами во внеклеточном домене .
. Каждая субъединица содержит четыре альфа-спирали, проходящие через мембрану (M1, M2, M3, M4). Пора образована преимущественно спиралями М2. Линкер M3-M4 представляет собой внутриклеточный домен, связывающий цитоскелет.
Большинство знаний о рецепторах cys-loop из выводов, сделанных при изучении различных членов семьи. Исследования структур ацетилхолинсвязывающих белков (AChBP) показали, что сайты связывания состоят из шести петель, причем первые три образуют основную поверхность, а следующие три - дополнительную сторону. Последняя петля на основной грани охватывает лиганд активного рецептора. Этот сайт также изобилует ароматическими остатками.
Недавняя литература указывает, что остаток Trp на петле B является критическим для связывания как агониста, так и антагониста. Нейромедиатор попадает в сайт связывания, где он взаимодействует (через водород и связь катион-π ) с аминокислотой, находящейся в ароматическом боксе, расположенном на основной стороне связывания. сайт. Другое важное взаимодействие происходит между агонистом и тирозином на петле С. При взаимодействии петля претерпевает конформационные изменения и поворачивается вниз, закрывая молекулу в сайте связывания.
Изображение никотинового ацетилхолинового рецептора - наиболее часто изучаемого члена надсемейства рецепторов Cys-LoopБлагодаря исследованиям никотиновых ацетилхолиновых рецепторов было установлено, что каналы активируются через аллостерические взаимодействия между связывающим и гейтирующим доменами. Как только агонист связывается, он вызывает конформационные изменения (включая перемещение бета-листа аминоконцевого домена и перемещение наружу от петель 2, F и cys-петли, которые связаны с линкером M2-M3 и открывают канал). Электронная микроскопия (при 9 Å) показывает, что отверстие вызвано вращением в домене M2, но другие исследования кристаллических структур этих рецепторов показали, что отверстие может быть результатом наклона M2, который приводит к к расширению пор и четвертичному повороту всего пентамерного рецептора.