Войти
 | |
| Тип | Частная компания |
|---|---|
| Промышленность | Биоинформатика |
| Основана | 2005 |
| Штаб-квартира | Орхус, Дания |
| Обслуживаемая территория | Дания. Кембридж, Массачусетс. Токио. Тайбэй. Дели |
| Продукты | Программное обеспечение и консалтинг |
| Веб-сайт | http://www.clcbio.com |
CLC bio была компанией по разработке программного обеспечения для биоинформатики со штаб-квартирой в Орхусе, Дания, а также с офисами в Кембридже, Массачусетс, Токио, Тайбэй и Дели. Программное обеспечение компании CLC bio имеет более 250 000 пользователей в более чем 100 странах мира. CLC bio была приобретена QIAGEN в 2013 году и продолжает существовать как часть подразделения исследований и разработок в области биоинформатики QIAGEN.
CLC bio разрабатывает широко цитируемые настольные, корпоративные и облачные системы программное обеспечение для анализа биологических данных. Предлагая некоторые алгоритмы с открытым исходным кодом со своими инструментами, CLC bio имеет собственные реализации нескольких популярных приложений, которые были ускорены с помощью технологии SIMD. В 2010 году CLC bio была первой коммерческой платформой для биоинформатического анализа, в которой использовался графический пользовательский интерфейс для создания, управления и развертывания рабочих процессов анализа.
Помимо других функций, программное обеспечение поддерживает чтение карт Сэнгера и высокопроизводительное секвенирование данных, de novo сборка Sanger и высокопроизводительное секвенирование данных, обнаружение SNP на полных геномах любого размера, обнаружение структурные вариации полных геномов любого размера, анализ ChIP-seq, анализ RNA-Seq, анализ малых РНК и BLAST. CLC bio также предоставляет дополнительные плагины (как бесплатные, так и коммерческие), которые расширяют платформу для использования в конкретных предметных областях, включая завершение генома, микробную геномику и структурную биологию.
Программное обеспечение CLC bio позволяет пользователю анализировать, визуализировать и сравнивать геномные, транскриптомные и эпигеномные данные со всех основных платформ высокопроизводительного секвенирования, таких как Illumina, Life Technologies, Roche 454, Pacific Biosciences, Oxford Nanopore и Complete Genomics. Программное обеспечение CLC bio не зависит от платформы и может использоваться для Mac OS X, Windows и Linux. Платформа включает графический пользовательский интерфейс рабочего стола, инструменты командной строки, SOAP и REST API, а также возможность запускать контейнерные инструменты.
Аналитическая платформа CLC bio была установлена в нескольких мировых научно-исследовательских учреждениях и в более чем 2000 различных организациях по всему миру, включая 10 ведущих фармацевтических компаний в мире.
В 2017 году CLC bio запустила свой облачный движок CLC Genomics Cloud Engine как платформу с командной строкой для выполнения рабочих процессов облачной биоинформатики в Amazon Web Services. В 2019 году эта платформа была адаптирована и одобрена для использования в AWS GovCloud. В 2020 году CLC bio выпустила бесплатный подключаемый модуль, который позволяет выполнять рабочие процессы на AWS непосредственно из программного обеспечения для настольных ПК CLC Genomics Workbench.
Вначале компания представила собственные высокопроизводительные вычислительные решения, уделяя особое внимание ускорению алгоритмов с открытым исходным кодом, таких как HMMER, Smith-Waterman и ClustalW с использованием технологии FPGA. CLC bio больше не разрабатывает собственные аппаратные продукты.
CLC bio начала коммерческую деятельность 1 января 2005 года со штаб-квартирой в Дании. Это прибыльная частная компания со 100 сотрудниками, которая была приобретена Qiagen в конце 2013 года. 30% сотрудников имеют докторскую степень, а еще 50% - степень магистра.
CLC. bio поддерживает научную направленность, инициируя и участвуя в различных исследовательских проектах по всему миру, включая несколько проектов, финансируемых за счет грантов.
