Войти
 | |
 SimThyr 3.1 на openSUSE 11 | |
| Автор (ы) | Йоханнес В. Дитрих, Улла Мицдорф, Ренате Пикардт, Рудольф Хурманн, Джон Э.М. Мидгли |
|---|---|
| Разработчик (и) | Рурский университет Бохум |
| Первый выпуск | 2002 |
| Стабильная версия | 4.0.3 / 31 августа 2020 г.; 43 дня назад (2020-08-31) |
| Репозиторий |  |
| Написано на | Pascal и Object Pascal |
| Операционная система | macOS, Windows и Linux |
| Platform | PowerPC, IA-32, x86-64 и ARM,. m68k (только устаревшие версии) |
| Доступно в | Британский английский, немецкий (только SimThyr 2.0 или старше) |
| Тип | Бесплатное научное прикладное программное обеспечение для физиологического моделирования |
| Лицензия | в стиле BSD |
| Веб-сайт | simthyr.sourceforge.net |
SimThyr - это бесплатная программа непрерывного динамического моделирования для системы гипофиз-тиреоидный контроль с обратной связью. Программа с открытым исходным кодом основана на нелинейной модели гомеостаза щитовидной железы. Помимо моделирования во временной области , программное обеспечение поддерживает различные методы анализа чувствительности. Он предоставляет GUI, который позволяет визуализировать временной ряд, изменять постоянные структурные параметры контура обратной связи (например, для моделирования определенных болезни), сохраняя наборы параметров в виде файлов XML (в программном обеспечении называемые «сценариями») и экспортируя результаты моделирования в различные форматы, подходящие для статистического программного обеспечения. SimThyr в первую очередь предназначен для образовательных целей и in-silico исследований.
Основная модель гомеостаза щитовидной железы основана на фундаментальных биохимических, физиологических и фармакологических принципах, например кинетика Михаэлиса-Ментен, неконкурентное ингибирование и эмпирически обоснованные кинетические параметры. Модель была проверена на здоровых пациентах и в когортах пациентов с гипотиреозом и тиреотоксикозом.
SimThyr, используемый в образовательных целях в компьютерном ресурсном центре В нескольких исследованиях SimThyr использовался для in silico исследований по контролю функции щитовидной железы.
Первоначальная версия была разработана для проверки гипотез о генерации выпуска импульсивного TSH. Более поздние и расширенные версии программного обеспечения были использованы для разработки гипотезы оси гипоталамус-гипофиз-щитовидная железа, для оценки достоверности рассчитанных параметров гомеостаза щитовидной железы (включая SPINA-GT и SPINA -GD ) и для изучения аллостатических механизмов, ведущих к синдрому не тиреоидного заболевания.
SimThyr также использовался, чтобы показать, что скорость высвобождения тиреотропина контролируется множеством факторов, кроме T4 и что соотношение между свободным T4 и ТТГ может быть различным при эутиреозе, гипотиреозе и тиреотоксикозе.
SimThyr - это бесплатное и программное обеспечение с открытым исходным кодом. Это обеспечивает доступность исходного кода , что облегчает научное обсуждение и обзор базовой модели. Кроме того, тот факт, что он доступен бесплатно, может дать экономическую выгоду.
Программное обеспечение предоставляет редактор, который позволяет пользователям изменять большинство параметров структуры структуры обработки информации. Эта функция позволяет моделировать несколько функциональных заболеваний щитовидной железы и гипофиза. Наборы параметров могут быть сохранены как файлы XML, соответствующие MIRIAM и MIASE.
С другой стороны, сложность пользовательского интерфейса и отсутствие возможности моделировать эффекты лечения подвергались критике.
