Partitiviridae | |
---|---|
CryoEM из Penicillium stoloniferum вируса S капсида, EMD-5161 | |
TEM из Penicilllium stoloniferum вируса S | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Царство: | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Писувирикота |
Учебный класс: | Duplopiviricetes |
Заказ: | Дурнавиралес |
Семья: | Partitiviridae |
Partitiviridae - это семейство двухцепочечных РНК-вирусов. Растения, грибы и простейшие служат естественными хозяевами. Название происходит от латинского partitius, что означает разделенный, и относится к сегментированному геному партитивирусов. В семействе пять родов и 60 видов, 15 из которых не принадлежат к роду.
Вирусы семейства Partitiviridae не имеют оболочки с икосаэдрической геометрией и симметрией T = 1. Диаметр партитивирусов составляет около 25–43 нм.
Партитивирусы имеют геномы двухцепочечной РНК, разделенные на два геномных сегмента, и могут быть дополнительные субгеномные сегменты. Два сегмента генома упакованы в отдельные вирусные частицы. Они кодируют два отдельных белка. Первый сегмент кодирует РНК-зависимую РНК-полимеразу (RdRp), а второй сегмент кодирует белок оболочки. Сегменты имеют длину примерно 1,4–3,0 т.п.н., а общая длина генома составляет примерно 3,0–4,8 т.п.н.
Репликация вируса происходит в цитоплазме. Попадание в хозяйскую клетку достигается путем проникновения в хозяйскую клетку. Репликация следует модели репликации вируса с двухцепочечной РНК. Транскрипция двухцепочечной РНК вируса - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина путем перемещения от клетки к клетке. Естественным хозяином служат грибы и растения. Криповирусы инфицируют апикомплексные простейшие из рода Cryptosporidium, а вирусы других родов заражают растения и грибы.
Род | Детали хоста | Тканевый тропизм | Детали входа | Детали выпуска | Сайт репликации | Сайт сборки | Передача инфекции |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Криповирус | Протисты | Никто | Деление клеток; спорогенез; гифальный анастомоз | Деление клеток; спорогенез; гифальный анастомоз | Цитоплазма | Цитоплазма | Деление клеток; спорогенез; гифальный анастомоз |
Alphapartitivirus | Никто | Цитоплазма | Цитоплазма | Деление клеток | |||
Дельтапартивирус | Растения | Никто | Вирусное движение; механическая инокуляция | Деление клеток | Цитоплазма | Цитоплазма | Деление клеток |
Бетапартивирус | Никто | Цитоплазма | Цитоплазма | Деление клеток | |||
Гаммапартитивирус | Грибы | Никто | Цитоплазматический обмен; гифальный анастомоз | Цитоплазматический обмен; гифальный анастомоз | Цитоплазма | Цитоплазма | Цитоплазматический обмен; гифальный анастомоз |
По гену РНК-полимеразы эту группу можно разделить на четыре клады (I-IV). Пятую кладу составляют четыре изолята от животных и простейших. Клады I – IV состоят из смесей партитивирусоподобных последовательностей растений и грибов.
В семействе Partitiviridae есть пять признанных родов. В семействе есть еще пятнадцать видов, не относящихся к роду:
Alphapartitivirus
Бетапартивирус
Дельтапартивирус
Гаммапартитивирус
Не отнесено к роду: