Partitiviridae

редактировать

Partitiviridae
Emd-5161.jpg
CryoEM из Penicillium stoloniferum вируса S капсида, EMD-5161
ODR.Partiti.Fig1.v1.png
TEM из Penicilllium stoloniferum вируса S
Классификация вирусов е
(без рейтинга): Вирус
Царство: Рибовирия
Королевство: Орторнавиры
Тип: Писувирикота
Учебный класс: Duplopiviricetes
Заказ: Дурнавиралес
Семья: Partitiviridae

Partitiviridae - это семейство двухцепочечных РНК-вирусов. Растения, грибы и простейшие служат естественными хозяевами. Название происходит от латинского partitius, что означает разделенный, и относится к сегментированному геному партитивирусов. В семействе пять родов и 60 видов, 15 из которых не принадлежат к роду.

СОДЕРЖАНИЕ
  • 1 Структура
  • 2 Геном
  • 3 Жизненный цикл
  • 4 Филогенетика
  • 5 Таксономия
  • 6 Ссылки
  • 7 Внешние ссылки
Структура
Penicillium stoloniferum вируса F (PSV-F), Gammapartititvirus и PSV-F CP димер

Вирусы семейства Partitiviridae не имеют оболочки с икосаэдрической геометрией и симметрией T = 1. Диаметр партитивирусов составляет около 25–43 нм.

Геном
Геном вируса гипоксилона atkinsonella (AhV) рода Betapartitivirus

Партитивирусы имеют геномы двухцепочечной РНК, разделенные на два геномных сегмента, и могут быть дополнительные субгеномные сегменты. Два сегмента генома упакованы в отдельные вирусные частицы. Они кодируют два отдельных белка. Первый сегмент кодирует РНК-зависимую РНК-полимеразу (RdRp), а второй сегмент кодирует белок оболочки. Сегменты имеют длину примерно 1,4–3,0 т.п.н., а общая длина генома составляет примерно 3,0–4,8 т.п.н.

Жизненный цикл

Репликация вируса происходит в цитоплазме. Попадание в хозяйскую клетку достигается путем проникновения в хозяйскую клетку. Репликация следует модели репликации вируса с двухцепочечной РНК. Транскрипция двухцепочечной РНК вируса - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина путем перемещения от клетки к клетке. Естественным хозяином служат грибы и растения. Криповирусы инфицируют апикомплексные простейшие из рода Cryptosporidium, а вирусы других родов заражают растения и грибы.

Филогенетика

По гену РНК-полимеразы эту группу можно разделить на четыре клады (I-IV). Пятую кладу составляют четыре изолята от животных и простейших. Клады I – IV состоят из смесей партитивирусоподобных последовательностей растений и грибов.

Таксономия
Филогенетическое дерево Partitiviridae

В семействе Partitiviridae есть пять признанных родов. В семействе есть еще пятнадцать видов, не относящихся к роду:

Alphapartitivirus

  • Криптический вирус свеклы 1
  • Морковный криптический вирус
  • Партитивирус, связанный с хлоротической ржавой пятнистостью вишни
  • Криптический вирус Chondrostereum purpureum 1
  • Вирус коричневого цвета Flammulina velutipes
  • Helicobasidium mompa partitivirus V70
  • Партитивирус гетеробазидиона 1
  • Партитивирус гетеробазидиона 3
  • Партитивирус гетеробазидиона 12
  • Партитивирус гетеробазидиона 13
  • Гетеробазидион партитивирус 15
  • Rosellinia necatrix partitivirus 2
  • Шифровальный вирус Vicia
  • Криптический вирус белого клевера 1

Бетапартивирус

  • Вирус гипоксилона Аткинсонеллы
  • Загадочный вирус каннабиса
  • Вирус Ceratocystis RESINIFERA 1
  • Загадочный вирус малинового клевера 2
  • Криптический вирус укропа 2
  • Вирус Fusarium poae 1
  • Партитивирус гетеробазидиона 2
  • Партитивирус гетеробазидиона 7
  • Гетеробазидион партитивирус 8
  • Партитивирус гетеробазидиона P
  • Загадочный вирус трилистника хмеля 2
  • Вирус Pleurotus ostreatus 1
  • Вирус Primula malacoides 1
  • Загадочный вирус красного клевера 2
  • Вирус Rhizoctonia solani 717
  • Вирус Rosellinia necatrix 1
  • Криптический вирус белого клевера 2

Криповирус

Дельтапартивирус

  • Загадочный вирус свеклы 2
  • Загадочный вирус свеклы 3
  • Инжирный криптический вирус
  • Загадочный вирус перца 1
  • Загадочный вирус перца 2

Гаммапартитивирус

  • Вирус Aspergillus ochraceous
  • Discula destructiva вирус 1
  • Discula destructiva вирус 2
  • Вирус Fusarium solani 1
  • Gremmeniella abietina РНК вируса MS1
  • Партитивирус офиостомы 1
  • Penicillium stoloniferum вирус F
  • Penicillium stoloniferum вирус S

Не отнесено к роду:

  • Вирус Agaricus bisporus 4
  • Криптический вирус люцерны 1
  • Загадочный вирус гвоздики 1
  • Морковный вирус умеренного климата 1
  • Морковный умеренный вирус 2
  • Вирус умеренного климата моркови 3
  • Вирус умеренного климата моркови 4
  • Вирус Gaeumannomyces graminis 0196A
  • Вирус Gaeumannomyces graminis T1A
  • Криптический вирус трилистника хмеля 1
  • Криптический вирус трилистника хмеля 3
  • Вирус желтого края редиса
  • Загадочный вирус Райграсс
  • Вирус умеренного климата шпината
  • Криптический вирус белого клевера 3
использованная литература
внешние ссылки
Последняя правка сделана 2023-03-21 05:56:23
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте