Olex2

редактировать

Olex и Olex2 - универсальное программное обеспечение re для кристаллографических исследований. Olex раньше был исследовательским проектом, разработанным во время PhD для реализации топологического (как связность) анализа полимерных химических структур, и до сих пор широко используется используется по всему миру. Olex2 - это проект с открытым исходным кодом с кодом C ++, переносимым в Windows, Mac и Linux. Хотя проекты имеют общее имя, они не связаны на уровне исходного кода.

Olex

Программа Olex предназначена для анализа протяженных структурных сетей. Он работает только в системах Windows, а исходный код доступен только по запросу. Это позволяет упаковывать структуру, строить топологическую сеть и оценивать символы сетей Schläfli и вершин, а также создавать растровые изображения модели, видимые на экране. Такой вид топологического сетевого анализа обычно проводится для определения релевантности рассматриваемых структур и, возможно, для прогнозирования физических свойств исследуемого материала.

Olex2 - относительно новое программное обеспечение с открытым исходным кодом с лицензией BSD, которое предоставляет инструменты от решения кристаллографической структуры до подготовки окончательного отчета. Он все еще находится в стадии активной разработки. Независимый от платформы графический интерфейс пользователя Olex2 предоставляется wxWidgets. Olex2 имеет расширенный интерфейс на основе HTML, дополненный графикой Pillow и OpenGL. Olex2 предоставляет множество инструментов для структурного анализа и публикации, включая карты Фурье и расчет и визуализацию пустот, определение пространственной группы, расчет esd практически для любых возможных геометрических параметров, CIF перевод в HTML и другие документы, размещение атома водорода и многие другие. Olex2 обеспечивает окончательный вывод изображения в виде растровых изображений или вывода PostScript, Ortep-like или POV-Ray. Программное обеспечение предоставляется в виде предварительно собранных двоичных файлов для Windows, Mac и Linux, а также в виде исходного кода. Несколько сценариев сборки (SCons, CMake и make ) предоставлены для помощи в разработке Olex2, но только SCons поддерживаются повсюду и используются для каждого обновления выпуска и любые проблемы должны быть адресованы болельщикам. Olex2 теперь поддерживается компанией OlexSys Ltd.

Поскольку графический интерфейс Olex2 состоит из двух компонентов - ядра Olex2, написанного на C ++ и предоставляющего базовую модель графическому интерфейсу пользователя, в основном на основе кода Python. Такое разделение позволяет расширить Olex2 с помощью пользовательских сценариев и использовать его функциональные возможности пользователем на различных уровнях - операции с индексами Миллера, манипуляции с файлами и многие другие.

Olex2 предоставляет набор коммерческих расширений:

  • 3DPlus: предоставляет способ вывода файлов STL, VRML и PLY для 3D-печати
  • ReportPlus: профессионально выглядящие отчеты об определении структуры, включая возможность объединить структуры
Официальный сайт

http://www.olexsys.org

Ссылки
Последняя правка сделана 2021-06-01 10:23:04
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте