Войти
| предшественник микроРНК lin-4 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности lin-4 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | lin-4 |
| Rfam | RF00052 |
| miRBase | MI0000002 |
| семейство miRBase | MIPF0000303 |
| Прочие данные | |
| тип РНК | Джин ; miRNA |
| Домен(s) | Eukaryota |
| GO | 0035195 0035068 |
| SO | 0001244 |
| PDB структуры | PDBe |
In молекулярный biology lin-4 представляет собой микроРНК (miRNA), которая была идентифицирована в результате исследования времени развития нематоды Caenorhabditis elegans. Это была первая открытая miRNA, класс некодирующих РНК, участвующих в регуляции генов. miRNA транскрибируются как предшественники ~ 70 нуклеотидов и впоследствии обрабатываются ферментом Dicer с образованием 21 нуклеотидного продукта. Степень предшественников шпильки обычно не известна и оценивается на основе прогноза шпильки. Считается, что продукты выполняют регуляторные функции за счет полной или частичной комплементарности мРНК. Было обнаружено, что ген lin-4 находится в интроне размером 4,11 kb отдельного гена-хозяина (см. Также [1] ).
lin-4 транскрибируется с автономных промоторов miRNA и регулируется в процессе развития, с накоплением lin-4 miRNA на стадии L2 постэмбрионального развития. В дополнение к этому происходит активация первичных транскриптов эндогенных lin-4 при появлении зрелой формы lin-4. lin-4 обнаружен на хромосоме II C. elegans и комплементарен последовательностям в 3 'нетранслируемой области (UTR) мРНК lin-14, этот комплементарный транскрипт содержит семь сайтов связывания вместе с 9 нуклеотидами. основной элемент CUCAGGGAA. Видно, что дуплекс lin-4: lin-14 принимает необычную изогнутую структуру, вызванную индуцированными изменениями в размере канавки и укладке оснований из-за несовпадения пар оснований. Эта пара lin-4: lin-14 была связана с путем IGF-1 у C. elegans в отношении их модификации развития.
lin-4 диктует начало личиночных стадий развития C. elegans. Мутации lin-4 с потерей функции (lf) приводят к замедлению судьбы развития от их изначально ранних до более поздних личиночных стадий. Последствия включают гетерохронные паттерны развития с потерей таких структур, как вульва и кутикула взрослого человека. lin-4 действует как негативный регулятор lin-14 и подавляет накопление белка LIN-14. Он также нацелен на lin-28 и снижает экспрессию его белка за счет ингибирования трансляции. Спаривание оснований между lin-4 и рассматриваемой мишенью является прерывистым и состоит из двух коротких спиралей.
