Войти
| Карисса Ю. Санбонмацу | |
|---|---|
 | |
| Альма mater | Колумбийский университет. Университет Колорадо в Боулдере. Кембриджский университет |
| Известный | структурной биологией. Первое моделирование рибосомы. Первое моделирование миллиона атомов. Первое моделирование ген. Моделирование первого миллиарда атомов. Первое структурное исследование днРНК. Квазилинейное моделирование Захарова |
| Награды | Президентская премия за раннюю карьеру для ученых и инженеров. Член Американского физического общества. Научный лектор Общества Стокса Колледжа Пембрук Конкуренция |
| Научная карьера | |
| Учреждения | Лос-Аламосская национальная лаборатория. |
| Диссертация | Конкуренция между ленгмюровскими взаимодействиями волна-волна и волна-частица в авроральной ионосфере |
| Консультант | Мартин V Гольдман |
Карисса Ю. Санбонмацу - американский структурный биолог из Национальной лаборатории Лос-Аламоса. Она работает над механизмом некодирующих комплексов РНК, включая рибосому, рибопереключатели, длинные некодирующие РНК, а также хроматин. Она была первой, кто выполнил атомистическое моделирование рибосомы, определил вторичную структуру интактной днРНК и опубликовал моделирование одного миллиарда атомов биомолекулярной комплекс.
Санбонмацу родился в Рочестер, Нью-Йорк, дочь Джоан Ловеридж-Санбонмацу и Акиры Ловеридж-Санбонмацу, которые оба являются профессорами речевой коммуникации в Государственном университете Нью-Йорка. Она посещала среднюю школу Освего и была прощальной певицей. Она выиграла конкурс научных лекций Пембрук-Колледжа Общества Стокса в Кембриджском университете. Санбонмацу изучала физику в Колумбийском университете, где с помощью радиотелескопа Very Large Array оценила расстояние до остатка сверхновой G27.4 + 0.0 и его центральной точки X. -источник излучения, который сейчас известен как магнитар. Первые исследования Кариссы были в области физики плазмы. Она получила докторскую степень в астрофизических науках в Университете Колорадо в Боулдере под руководством Мартина В. Голдмана (ученика Дональда Ф. Дюбуа). Ее диссертация включала аналитическое рассмотрение нелинейных волновых взаимодействий в плазме, освещая конкуренцию между ленгмюровскими эффектами волны-волны и волны-частицы в авроральной ионосфере. В 1997 году, после получения докторской степени, Санбонмацу поступила в Лос-Аламосскую национальную лабораторию в качестве постдокторанта под руководством Дональда Ф. Дюбуа (ученика Мюррея Гелл-Манна ), определяя эффект кинетики. процессы на ленгмюровских волнах в плазме. Она заинтересовалась тем, что отличает жизнь от материи. В 2002 году Лос-Аламосская национальная лаборатория построила Q-machine, один из самых быстрых суперкомпьютеров в мире. Q-машина позволила Санбонмацу провести крупнейшее в мире моделирование в области биологии, опубликовав первое моделирование рибосомы в 2005 году, в котором она определила «коридор аккомодации» рибосомы. 96>
В 2006 году Санбонмацу был первым трансгендером в Национальной лаборатории Лос-Аламоса, удостоенным Президентской премии за раннюю карьеру для ученых и инженеров. В то время эпигенетика только начинала развиваться, и Санбонмацу понял, что РНК может быть вовлечена в то, как гены включаются и выключаются.
Лаборатория Санбонмацу в Лос-Аламосская национальная лаборатория была основана в 2001 году. Они используют различные лабораторные и вычислительные методы для изучения рибосом, длинных некодирующих РНК (днРНК), рибопереключателей и хроматин. Санбонмацу был ведущей фигурой в структурных исследованиях длинных некодирующих РНК в эпигенетике. Она изучала COOLAIR, участок РНК, который контролирует время и цветение растений. Он работает, управляя внутренними триггерами, которые сообщают растению о прекращении цветения, которые работают в сочетании с репрессорным белком, называемым Flowering Locus C. Когда Санбонмацу изучила структуру РНК, она обнаружила признаки, похожие на рибосомы. В 2012 году ее группа была первой, кто описал вторичную структуру в днРНК ; активатор рецептора стероидного гормона (SRA ). Она продолжила изучение того, как структура РНК влияет на судьбу клетки. Она использует секвенирование красителя illumina для высокой производительности Зондирование ФОРМЫ.
Моделирование первого миллиарда атомов целого гена (GATA4). Она разрабатывает компьютерное моделирование, чтобы понять тРНК транслокация, сочетающая флуоресценцию одиночных молекул с криогенной электронной микроскопией. Рибосомы претерпевают резкие изменения в структуре при прохождении транспортной РНК, и это было смоделировано с помощью вычислений Sanbonmatsu. Санбонмацу также писал о гинандроморфизме и о том, как ДНК влияет на гормоны, но гормон может перепрограммировать ДНК. Она была избрана членом Американского физического общества в 2012 году. Совсем недавно ее группа установила рекорд по крупнейшему в мире опубликованному биомолекулярному моделированию в один миллиард атомов, первое моделирование всего гена..
Она описала свою работу с эпигенетикой и выступила трансгендером в 2014 TEDxTalk. Санбонмацу выступила с докладом TED на TEDWomen о биологии пола, от ДНК до мозга, в ноябре 2018 года. В своем выступлении она рассказала о эпигенетике, как ДНК может измениться из-за травмы и диеты, а также из-за того, как изменение пола привело ее к изучению роли эпигенетики в гендерной идентичности. Санбонмацу входит в совет директоров Equality New Mexico.
