Домен CUB

CUB-домен - эволюционно консервативный белковый домен.

CUB-домен ( для комплемента C1r / C1s, Uegf, Bmp1) представляет собой структурный мотив из примерно 110 остатков, обнаруженных почти исключительно во внеклеточных и связанных с плазматической мембраной белках, многие из которых регулируются в процессе развития. Эти белки участвуют в разнообразных функциях, включая активацию комплемента, формирование паттерна развития, восстановление тканей, ведение аксонов и ангиогенез, передачу сигналов клеток, оплодотворение, гемостаз, воспаление, нейротрансмиссию, рецептор-опосредованный эндоцитоз и подавление опухоли. Многие CUB-содержащие белки представляют собой пептидазы, принадлежащие к семействам пептидаз MEROPS M12A (астацин) и S1A (химотрипсин).

Белки, содержащие домен CUB, включают:

• субкомпоненты комплемента млекопитающих C1s / C1r, которые образуют кальций-зависимый комплекс C1, первый компонент классического пути системы комплемента..
• (хомяк) сериновая протеаза Casp, которая расщепляет коллаген I и IV типов и фибронектин в присутствии кальция.
• Компонент Ra-реактивного фактора (RARF), активирующий комплемент млекопитающих, a протеаза, которая расщепляет компонент C4 комплемента.
• Позвоночные энтеропептидаза (EC 3.4.21.9 ), мембранный белок типа II щеточной каймы кишечника, который активирует трипсиноген.
• Морфогенный белок 1 костей позвоночных (BMP-1 ), белок, который индуцирует образование хрящей и костей и экспрессирует активность металлоэндопептидазы.
• Белки бластулы морского ежа BP10 и SpAN.
• C. elegans гипотетические белки F42A10.8 и R151.5.
• нейропилин (антиген A5), кальций-независимая молекула клеточной адгезии, которая действует во время формирования определенных нейронных цепей.
• I и III из Strongylocentrotus purpuratus (пурпурный морской еж).
• Гиалуронат-связывающий белок млекопитающих TSG-6 (или PS4), белок, индуцированный сывороткой и фактором роста.
• Спермадгезины млекопитающих.
• Xenopus laevis эмбриональный белок UVS.2, который экспрессируется во время дорсо-переднего развития.

Некоторые из вышеперечисленных белков состоят из каталитического домена вместе с несколькими доменами CUB, перемежающимися связыванием кальция Домены EGF.

Спермадгезин является подразделением семейства доменов CUB и образует основной компонент семенной жидкости млекопитающих. Спермадгезины представляют собой полипептиды из 110-133 аминокислот. Связывающая активность спермадгезинов, например связывание гепарина и углеводов делает возможным их центральную роль в способствовании прикреплению сперматозоидов к углеводным группам гликопротеинов, обнаруженных на поверхности ооцитов. Спермадгезины свиней, быков и жеребцов демонстрируют 40-98% сходства в их аминокислотных последовательностях, и все они обладают дисульфидной связью между соседними остатками цистеина. Полипептиды свиного спермадгезина кодируются пятью тесно связанными генами. Спермадгезин крупного рогатого скота основан на значительно меньшем количестве генов, и только два из них связаны с экспрессией этого белка в семенной жидкости крупного рогатого скота. Избыточное генетическое кодирование спермадгезинов наблюдалось у шимпанзе, собак и людей. Область, коррелирующая с генами спермадгезина в ДНК крыс и мышей, лишена какого-либо кода спермадгезина. Эти вариации в экспрессии и генетическом кодировании спермадгезинов, как видно, являются результатом эволюционных корректировок в генах как следствие мутаций и делеций в генетическом материале.

Некоторые домены CUB, по-видимому, участвуют в олигомеризации и / или распознавании субстратов и партнеров по связыванию. Например, в протеазах комплемента домены CUB опосредуют димеризацию и связывание с коллагеноподобными областями белков-мишеней (например, C1q для C1r / C1s). Структура доменов CUB состоит из бета-сэндвича с складкой желе-ролла. Почти все домены CUB содержат четыре консервативных цистеина, которые, вероятно, образуют два дисульфидных мостика (C1-C2, C3-C4). Домены CUB1 C1s и Map19 имеют сайты связывания кальция.

Гены человека, кодирующие белки, содержащие этот домен, включают:

• ATRN, BMP1,
• C1R, C1S, CSMD1, CSMD2, CUBN, CUZD1,
• , DCBLD2, DMBT1,,
• GPR126,
• KREMEN1,
• LRP10, LRP3,
• , MASP2, MFRP,
• NETO1, NRP1, NRP2,
• ,,
• PCOLCE, PCOLCE2, PDGFC, PDGFD,,
• ,
• SCUBE1, SEZ6, SEZ6L, ST14,
• TLL1, TLL2, TNFAIP6
• ПКК-2