Войти
| Лидер триптофанового оперона | |
|---|---|
 Прогнозируемая вторичная структура и сохранение последовательности Trp_leader | |
| Идентификаторы | |
| Symbol | Trp_leader |
| Rfam | RF00513 |
| Другие данные | |
| РНК тип | Cis -reg ; лидер |
| Домен (ы) | Бактерии |
| SO | 0000233 |
| PDB структуры | PDBe |
Лидер триптофанового оперона является элементом РНК обнаружен на 5 ′ некоторых бактериальных оперонах триптофана. Лидерная последовательность может предполагать две разные вторичные структуры, известные как терминаторная и анти-терминаторная структура. Лидер также кодирует очень короткую пептидную последовательность, богатую триптофаном. Структура терминатора распознается как сигнал терминации для РНК-полимеразы, и оперон не транскрибируется. Эта структура образуется, когда клетка имеет избыток триптофана и рибосома перемещению по транскрипту лидера не препятствует. При дефиците заряженной триптофанил тРНК рибосома, транслирующая лидерный пептид, останавливается, и может образовываться структура антитерминатора. Это позволяет РНК-полимеразе транскрибировать оперон.
Известно, что по меньшей мере 6 различных аминокислотных оперонов регулируются этим ослаблением.
TRAP 3 додекамер, Geobacillus stearothermophilus. Для образования терминатора необходим trp РНК-связывающий белок белок (белок TRAP) у видов Bacillus и родственных бактерий. Этот белок кодируется геном MtrB. Белок TRAP образует олигомер из 11 субъединиц, в присутствии триптофана он связывается с участком РНК, содержащим 11 (G / U) повторов AG. Эта последовательность перекрывает петлю против терминатора, таким образом, связывание TRAP предотвращает образование петли против терминатора. Когда TRAP связан, образуется петля терминтора, и оперон не транскрибируется.
Триптофановый РНК-связывающий аттенюаторный белок, ингибирующий белок (Anti-TRAP белок или AT) представляет собой короткий белок, кодируемый rtpA в Bacillus. Синтез анти-TRAP индуцируется незаряженным триптофаном тРНК. Анти-TRAP связывается с TRAP и ингибирует его связывание с лидером оператора триптофана. Это приводит к образованию петли против терминатора и транскрибированию триптофанового оперона.
