Малая ядрышковая РНК SNORD50 | |
---|---|
Прогнозируется вторичная структура и сохранение последовательности SNORD50 | |
Идентификаторы | |
Символ | SNORD50 |
Альт. Символы | U50 |
Rfam | RF00278 |
Другие данные | |
РНК тип | Ген ; мяРНК ; мяРНК ; CD-box |
Домен (ы) | Eukaryota |
GO | 0006396 0005730 |
SO | 0000593 |
PDB структуры | PDBe |
snoRNA U50 ( также известная как SNORD50 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая функционирует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным участком биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мяРНК) и также часто упоминается как направляющая РНК.
snoRNA U50 принадлежит к классу snoRNA C / D box, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства C / D-боксов управляют сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК.
U50 является интронной мяРНК ген, расположенный на хромосоме 6q15, в точке излома хромосомной транслокации t (3; 6) (q27; q15). Ген U50HG состоит из шести экзонов, чьи сплайсированные транскрипты имеют небольшой потенциал для кодирования белка, а его интроны продуцируют как U50, так и U50-подобные (U50 ') snoRNA, которые локализованы в ядрышках. Имеются данные о том, что паралоги U50 образуют новое семейство генов, контролирующих онкогенез и чувствительность к терапии при раке.
.