Скользкая последовательность

редактировать
Тандемное проскальзывание 2 тРНК на скользкой последовательности вируса саркомы Рауса. После сдвига рамки считывания новые пары оснований правильны в первом и втором нуклеотидах, но неверны в положении вобуляции. Указаны сайты E, P и A рибосомы. Расположение растущей полипептидной цепи не указано на изображении, поскольку еще не существует единого мнения о том, происходит ли проскальзывание -1 до или после того, как полипептид переносится с тРНК P-сайта на тРНК A-сайта (в данном случае от тРНК Asn к тРНК Leu тРНК).

A скользкая последовательность представляет собой небольшой участок кодона нуклеотидных последовательностей (обычно UUUAAAC), который контролирует скорость и вероятность рибосомного сдвига рамки считывания. Скользкая последовательность вызывает более быстрый перенос рибосомы, что, в свою очередь, может вызвать «проскальзывание» считывающей рибосомы. Это позволяет тРНК сдвигаться на 1 основание (-1) после того, как она спарилась со своим антикодоном, изменяя рамку считывания. Сдвиг кадра -1, запускаемый такой последовательностью, является запрограммированным сдвигом кадра -1 рибосомой. За ним следует спейсерная область и вторичная структура РНК. Такие последовательности являются обычными для вирусных полипротеинов.

Сдвиг рамки считывания происходит из-за спаривания вобуляции. Свободная энергия Гиббса вторичных структур ниже по потоку дает намек на то, как часто происходит сдвиг рамки. Напряжение на молекуле мРНК также играет роль. Список скользких последовательностей, обнаруженных в вирусах животных, доступен у Хуанга и др.

Скользкие последовательности, которые вызывают сдвиг на 2 основания (-2 сдвига рамки), были созданы из последовательности HIV UUUUUUA.

См. Также
Ссылки
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-06-08 05:58:47
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте