RNAIII

RNAIII
Предсказанная вторичная структура и консервация последовательности РНКIII
Идентификаторы
Символ	РНКIII
Rfam	RF00503
Другие данные
РНК тип	Ген
Домен (ы)	Бактерии
SO	0005836
PDB структуры	PDBe

РНКIII представляет собой небольшой РНК, которая, как известно, регулирует экспрессию многих генов Staphylococcus aureus, кодирующих экзопротеины и белки, связанные с клеточной стенкой. У S. aureus РНКIII действует как эффектор системы восприятия кворума agr и транскрибируется с оперона P3. Транскрипт RNAIII также содержит ген дельта-гемолизина из 26 аминокислот (hld). RNAIII регулирует экспрессию фактора транскрипции rot, блокируя его трансляцию. Было высказано предположение, что РНКIII связывается с мРНК rot антисмысловым образом, перекрывая последовательность Шайна-Дальгарно.

• Chevalier C, Boisset S, Romilly C, et al.. (Март 2010 г.). Cheung A (ред.). «РНК III Staphylococcus aureus связывается с двумя удаленными участками мРНК коа, чтобы остановить трансляцию и способствовать деградации мРНК». PLoS Pathog. 6 (3): e1000809. doi : 10.1371 / journal.ppat.1000809. PMC 2837412. PMID 20300607.
• Коэльо Л.Р., Соуза Р.Р., Феррейра Ф.А., Гимарайнш Массачусетс, Феррейра-Карвалью Б.Т., Фигейредо А.М. (ноябрь 2008 г.). «agr RNAIII дивергентно регулирует индуцированное глюкозой образование биопленок в клинических изолятах Staphylococcus aureus». Микробиология. 154 (Pt 11): 3480–3490. doi : 10.1099 / mic.0.2007 / 016014-0. PMID 18957601.
• Queck SY, Jameson-Lee M, Villaruz AE, et al. (Октябрь 2008 г.). «РНКIII-независимый контроль гена-мишени с помощью системы определения кворума agr: понимание эволюции регуляции вирулентности у Staphylococcus aureus». Мол. Cell. 32 (1): 150–158. doi : 10.1016 / j.molcel.2008.08.005. PMC 2575650. PMID 18851841.
• Симонетти О., Кириони О., Гизелли Р. и др. (Июнь 2008 г.). «Пептид, ингибирующий РНКIII, улучшает заживление ран, инфицированных устойчивым к метициллину Staphylococcus aureus». Антимикробный. Агенты Chemother. 52 (6): 2205–2211. DOI : 10.1128 / AAC.01340-07. PMC 2415788. PMID 18391046.
• Korem M, Gov Y, Kiran MD, Balaban N (октябрь 2005 г.). «Транскрипционное профилирование белка-мишени, активирующего РНКIII, главного регулятора вирулентности стафилококков». Заразить. Иммун. 73 (10): 6220–6228. DOI : 10.1128 / IAI.73.10.6220-6228.2005. PMC 1230921. PMID 16177293.
• Хан Й.Х., Ким Ю.Г., Ким Д.Й., Ха С.К., Локанатх Н.К., Ким К.К. (апрель 2005 г.). «Мишень RNAIII-активирующего белка (TRAP) из Staphylococcus aureus: очистка, кристаллизация и предварительный рентгеноструктурный анализ». Биохим. Биофиз. Acta. 1748 (1): 134–136. doi : 10.1016 / j.bbapap.2004.11.021. PMID 15752702.
• Ханцингер Э., Буассет С., Савиану С. и др. (Февраль 2005 г.). «РНК III Staphylococcus aureus и эндорибонуклеаза III координированно регулируют экспрессию гена spa». EMBO J. 24 (4): 824–835. doi : 10.1038 / sj.emboj.7600572. PMC 549626. ПМИД 15678100.
• Чабельская, С; Бордо, V; Фельден, Б. (1 апреля 2014 г.). «Двойной РНК-регуляторный контроль фактора вирулентности Staphylococcus aureus». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (8): 4847–4858. doi : 10.1093 / nar / gku119. PMC 4005698. PMID 24510101.

• Страница для RNAIII в Rfam