Пикромицин

Пикромицин

Имена
Название ИЮПАК (3R, 5R, 6S, 7S, 9R, 11E, 13S, 14R) -14-этил-13-гидрокси-3,5,7,9,13-пентаметил-2,4,10-триоксооксациклотетрадек-11-ен-6-ил 3,4,6-тридеокси-3 - (диметиламино) -β- D -ксилогексопиранозид
Другие названия Пикромицин
Идентификаторы
Номер CAS	19721-56-3
3D-модель ( JSmol )	Интерактивное изображение
ChEBI	CHEBI: 29665
ChemSpider	4445267
PubChem CID	5282037
UNII	FBM8G3Z439
InChI InChI = 1S / C28H47NO8 / c1-10-22-28 (7,34) 12-11-21 (30) 15 (2) 13-16 (3) 25 (18 (5) 23 (31) 19 (6) 26 (33) 36-22) 37-27-24 (32) 20 (29 (8) 9) 14-17 (4) 35-27 / ч 11-12,15-20,22, 24-25,27,32,34H, 10,13-14H2,1-9H3 / b12-11 + / t15-, 16 +, 17-, 18 +, 19-, 20 +, 22-, 24-, 25 +, 27 +, 28 + / m1 / s1 Обозначение: UZQBOFAUUTZOQE-VSLWXVDYSA-N InChI = 1S / C28H47NO8 / c1-10-22-28 (7,34) 12-11- 21 (30) 15 (2) 13-16 (3) 25 (18 (5) 23 (31) 19 (6) 26 (33) 36-22) 37-27-24 (32) 20 (29 (8) 9) 14-17 (4) 35-27 / ч11-12,15-20,22,24-25,27,32,34H, 10,13-14H2,1-9H3 / б 12-11 + / t15-, 16 +, 17-, 18 +, 19-, 20 +, 22-, 24-, 25 +, 27 +, 28 + / m1 / s1
УЛЫБКИ O = C2 [C @@ H] ([C @@ H] (O [C @@ H] 1O [C @@ H] (C [C @ H] (N (C) C) [C @ H] 1O) C) [C @@ H] (C) C [C @ H] (C (= O) / C = C / [C @@] (O) (C) [C @ H] (OC (= O) [C @@ H] 2C) CC) C) C
Свойства
Химическая формула	C28H47NO8
Молярная масса	525,683 г · моль
Если не указано иное, данные для материалов приведены в их стандартное состояние (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
N (что такое ?)
Ссылки ink

Пикромицин был изучен Брокманном и Хекелем в 1951 году и был первым выделенным антибиотиком макролидом. Пикромицин синтезируется с помощью системы поликетидсинтазы I типа I в Streptomyces venezuelae, виде грамположительных бактерий из рода Streptomyces. Пикромицин является производным 14-членного кольцевого макролида. Помимо нарбонолидного остова, пикромицин включает десозаминовый сахар и гидроксильную группу. Хотя пикромицин не является клинически полезным антибиотиком, его можно использовать в качестве исходного материала для синтеза антибиотических кетолидных соединений, таких как эритромицины и новые эпотилоны.

Пикромициновый поликетид синтаза Streptomyces venezuelae содержит четыре полипептида: PikAI, PikAII, PikAIII и PikAIV. Эти полипептиды содержат загрузочный модуль, шесть удлинительных молекул и домен тиоэстеразы, который завершает процедуру биосинтеза. Недавно электронная криомикроскопия была использована для определения трехмерных реконструкций с субнанометровым разрешением полноразмерного модуля PKS из бактерии Streptomyces venezuelae, которая обнаружила неожиданно другую архитектуру. На рисунке 1 каждый кружок соответствует мутилифукционному белку PKS, где ACP - белок-носитель ацила, KS - кето-ACP-синтаза, KSQ - домен, подобный кето-ACP-синтазе, AT - ацилтрансфераза, KR - кето ACP-редуктаза, KR с перекрестием - неактивный KR, DH - гидроксил-тиоэфирдегидратаза, ER - еноилредуктаза, TEI - домен I тиоэстеразы, TEII - тиоэстераза II типа. Des соответствует ферментам, используемым в биосинтезе и переносе дезозамина, включая DesI-DesVIII.

Фиг. 2 представляет путь биосинтеза дезозамин-дезоксиаминосахара. DesI-DesVI (место расположения пикромицина PKS) кодирует все ферменты, необходимые для получения TDP-дезоамина из TDP-глюкозы. Активности DesVII и DesVIII переводят дезоамин в нарбонолид и получают нарбомицин. Гидролаза цитохрома P450 PikC катализирует гидроксилирование нарбомицина с получением пикромицина.

Рисунок 1: Доменная организация PKS для нарбонолида, предшественника пикромицина Рисунок 2: Образование пикромицина посредством пути биосинтеза дезозамин-дезоксиаминосахара

• Поликетидсинтаза

1. ^Brockmann, Х. и Хенкель, В. (1951). «Пикромицин, ein bitter schmeckendes Antibioticum aus Actinomyceten». ntibiotica aus Actinomyceten. 84 : 184–288. doi : 10.1002 / cber.19510840306.
2. ^Y. Сюэ и Д. Шерман (2001). «Биосинтез и комбинаторный биосинтез макролидов, связанных с пикромицином в Streptomyces venezuelae». Метаболическая инженерия. 3 : 15–26. doi : 10.1006 / mben.2000.0167.
3. ^Маэдзава, Т. Хори, А. Кинумаки и М. Судзуки (1973). «Биологическое превращение нарбонолида в пикромицин». Журнал антибиотиков. 26 : 771–775. doi : 10.7164 / antibiotics.26.771. PMID 4792390. CS1 maint: несколько имен: список авторов (ссылка )
4. ^JD Kittendorf DH Sherman (2009). "The Methymycin / Путь биосинтеза пикромицина: модель метаболического разнообразия в натуральном продукте ». Bioorg Med Chem. 17 : 2137–2146. doi : 10.1016 / j.bmc. 2008.10.082. PMC 2843759. PMID 19027305.
5. ^С. Гуптаа; В. Лакшманан; Б.С. Кима; Р. Фечик KA Reynolds (2008). «Создание новых антибиотиков пикромицина посредством мутасинтеза». ChemBioChem. 10 : 1609–1616. doi : 10.1002 /cbic.200700635. PMC 2614871. PMID 18512859.
6. ^С. Датта; Дж. Р. Уичер; Д. А. Хансен; В. А. Хейл; JA Chemler; GR Congdon; ARH Narayan; K. Håkansson; DH Sherman; JL Smith; G. Skiniotis (2014). «Структура амодулярной поликетидсинтазы». Природа. 510 : 512–517. doi : 10.1038 / nature13423. PMC 4278352. PMID 24965652.
7. ^Д.Л. Ключ; J.D. Киттендорф; J.W. Жиральдес; Р.А. Fecik; Д. Х. Шерман и Дж. Л. Смит (2006). «Структурная основа макролактонизации пикромицинтиоэстеразой». Природа Химическая биология. 2 : 537–542. doi : 10.1038 / nchembio824. PMID 16969372.
8. ^Y. Сюэ и Д. Шерман (2001). «Биосинтез и комбинаторный биосинтез макролидов, связанных с пикромицином в Streptomyces venezuelae». Метаболическая инженерия. 3 : 15–26. doi :10.1006/mben.2000.0167.