Methylocella silvestris

Methylocella silvestris - это бактерия из рода Methylocella spp, которая встречается во многих кислых почвах и водно-болотных угодьях. Исторически сложилось, Methylocella Silvestris первоначально был выделен из кислых лесных почв в Германии, и она описывается как грамотрицательных, аэробных, неокрашенной, не- подвижны, форме стержня и метана - окисляющие факультативных метанотрофы. В качестве аэробных метанотрофных бактерий Methylocella spp используют метан (CH 4 ) и метанол в качестве основного источника углерода и энергии, а также мультисоставные ацетат, пируват, сукцинат, малат и этанол. Было известно, что они выживают при низких температурах от 4 до 30 градусов Цельсия с оптимальной температурой от 15 до 25 градусов, но не более 36 градусов. Они лучше растут в диапазоне pH от 4,5 до 7,0. В нем отсутствуют внутрицитоплазматические мембраны, общие для всех метанокисляющих бактерий, за исключением Methylocella, но есть везикулярная мембранная система, соединенная с цитоплазматической мембраной. BL2 ^T (= DSM 15510 ^T = NCIMB 13906 ^T) - типовой штамм.

• 1 Филогенетический
• 2 Геном
• 3 ссылки
• 4 Дальнейшее чтение
• 5 Внешние ссылки

Данфилд и др. Отметили, что Methylocella silvestris близкородственен Methylocella palustris K ^T, Beijerinckia indica ATCC 9039 и Methylocapsa acipihila B2 ^T с точки зрения филогенетики, что делает M. silvestris классифицированным как метанотроф типа II, который использует сериновый цикл для их ассимиляция углерода, но у него нет растворимой метанмонооксигеназы (sMMO) и пропанмонооксигеназы (PrMO).

Секвенирован геном Methylocella silvestris. Methylocella silvestris содержит восемь генов, которые могут кодировать НАД (P) -зависимые алкогольдегидрогеназы (ADH), пирролохинолинхинон (PQQ) -содержащую метанолдегидрогеназу (Msil_0471) и PQQ-содержащий ADH с 73% идентичностью xoxF из Methylobacterium extorquens. Чен и др. Заявили в своей статье, что размер генома составляет 4,3 Мбайт и имеет сходство с Proteobacteria.

• Вос П. В., Бреннер Д. Д., Стейли Дж. Т., Бун Д. Р., Гаррити ГМ, Гудфеллоу М., Криг Н. Р., Рейни Ф. А., Шлейфер К. Х. (2005). Руководство Bergeys? систематической бактериологии, том второй, протеобактерии, часть C, альфа-, бета-, дельта- и эпсилонпротеобактерии. Бостон, Массачусетс: Руководство Bergeys Manual Trust. ISBN   0-387-29298-5.
• Дедыш С.Н., Книф С., Данфилд П.Ф. (июль 2005 г.). «Виды Methylocella факультативно метанотрофны». Журнал бактериологии. 187 (13): 4665–70. DOI : 10.1128 / JB.187.13.4665-4670.2005. PMC   1151763. PMID   15968078.
• Рахман М.Т., Кромби А., Муссар Х., Чен Й., Мюррелл Дж. К. (июнь 2011 г.). «Ацетатное подавление окисления метана дополнительным Methylocella silvestris в микромире торфяной почвы». Прикладная и экологическая микробиология. 77 (12): 4234–6. DOI : 10,1128 / AEM.02902-10. PMC   3131658. PMID   21515721.
• Тайзен А.Р., Али М.Х., Радаевски С., Дюмон М.Г., Данфилд П.Ф., Макдональд И.Р. и др. (Ноябрь 2005 г.). «Регулирование окисления метана у факультативного метанотрофа Methylocella silvestris BL2». Молекулярная микробиология. 58 (3): 682–92. DOI : 10.1111 / j.1365-2958.2005.04861.x. PMID   16238619. S2CID   32124521.
• Чен Ю., Кромби А., Рахман М. Т., Дедыш С. Н., Лизак В., Стотт МБ и др. (Июль 2010 г.). «Полная последовательность генома аэробного факультативного метанотрофа Methylocella silvestris BL2». Журнал бактериологии. 192 (14): 3840–1. DOI : 10.1128 / JB.00506-10. PMC   2897342. PMID   20472789.

• "Methylocella silvestris" в Энциклопедии жизни
• LPSN
• Типовой штамм Methylocella silvestris в Bac Dive - база метаданных по бактериальному разнообразию