Семья LCP

редактировать
Связанный с клеточной оболочкой домен транскрипционного аттенюатора (каталитический домен TagU)
Идентификаторы
СимволLytR_cpsA_psr
Pfam PF03816
InterPro IPR004474
CATH 3tflA02
Семейство UniProt
Полиизопренилтейхоевая кислота - трансфераза пептидогликантейхоевой кислоты TagU
Идентификаторы
СимволTagU
InterPro IPR023734
описывает то же семейство; это полноразмерный белок
LytR / CpsA / Psr, С-концевой домен
Идентификаторы
СимволLytR_C
Pfam PF13399
InterPro IPR027381

Семейство LCP или семейство TagU представляет собой консервативное семейство из фосфотрансферазы, которые участвуют в прикреплении молекул тейхоевой кислоты (ТА) к грамположительной клеточной стенке или клеточной мембране. Первоначально он считался компонентом LytR (литического репрессора) оперона LytABC, кодирующего автолизины, но позже было выяснено, что механизм регуляции заключается в продукции молекул ТА. Соответственно, он был переименован в TagU.

Акроним «LCP» происходит от трех белков, изначально идентифицированных как содержащие этот домен, LytR (теперь TagU, Q02115 ), cpsA («Регулятор экспрессии капсульного полисахарида») и psr («репрессор синтеза PBP 5»). Эти белки были ошибочно приняты за регуляторы транскрипции по разным причинам, но теперь известно, что все они являются TagU-подобными ферментами. Хотя сам TagU только прикрепляет молекулы ТА к клеточной стенке пептидогликана (образуя WTA), другие белки LCP могут гликозилировать белки клеточной стенки (A. oris LcpA, PDB : 5V8C ) или прикреплять Молекулы ТА к якорю клеточной мембраны (образуя LTA). Большинство, если не все, белки LCP также обладают вторичной пирофосфатазной активностью.

Типичные белки TagU состоят из N-концевого трансмембранного домена (для закрепления), необязательного, неконсервативного вспомогательного домена (CATH 3tflA01), основной каталитический домен, а иногда и С-концевой домен, структура которого неизвестна. Основной домен LCP представляет собой магний-зависимый фермент.

Ссылки
Внешние ссылки
  • MetaCyc RXN-18030 : Полиизопренилтейхоевая кислота - трансфераза пептидогликантейхоевой кислоты
Последняя правка сделана 2021-05-26 08:26:23
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте