JASPAR

База данных открытого доступа, в которой хранятся тщательно отобранные профили привязки факторов транскрипции (TF) без избыточности

JASPAR

Содержание
Описание	база данных с открытым доступом профилей связывания факторов транскрипции
Типы данных. захваченные	эукариотические факторы транскрипции, их сайты связывания и профили связывания
Организмы	эукариоты
Контакты
Авторы	Санделин, А
Первичное цитирование	Санделин, А. и др. (2004)
Дата выпуска	2004
Доступ
Веб-сайт	http://jaspar.genereg.net/

JASPAR является открытым доступом и широко используемая база данных вручную подобранных, неизбыточных профилей связывания факторов транскрипции (TF), хранящихся в виде частотных матриц положения (PFM) и гибких моделей факторов транскрипции (TFFM) для TF от видов шести таксономических групп. Из предоставленных PFM пользователи могут генерировать матрицы весовых коэффициентов (PWM). База данных JASPAR была представлена ​​в 2004 году. В 2006, 2008, 2010, 2014, 2016 и 2018 годах было выпущено пять основных обновлений и новых выпусков, что является последней версией JASPAR.

База данных JASPAR является открытым исходным кодом и свободно доступна для научного сообщества по адресу http://jaspar.genereg.net/.

• TRANSFAC - База данных факторов транскрипции
• HOCOMOCO - HOmo sapiens КОМПЛЕКСНАЯ КОЛЛЕКЦИЯ MOdel
• PAZAR - База данных с акцентом на экспериментально подтвержденные сайты связывания факторов транскрипции
• TFe - энциклопедия факторов транскрипции
• AnimalTFDB - База данных факторов транскрипции животных
• PlantCARE - цис-регуляторные элементы и факторы транскрипции в растениях (2002)
• RegTransBase - сайты связывания факторов транскрипции в разнообразном наборе бактерий.
• RegulonDB - Первичная база данных по транскрипции регуляция в Escherichia coli
• TRRD - База данных регуляторных регионов транскрипции, в основном о регуляторных областях и T F-связывающие сайты
• PlantRegMap Карта регуляторов транскрипции растений

.