Interferome

ИНТЕРФЕРОМ

Содержание
Описание	база данных регулируемых генов интерферона
Организмы	Homo sapiens. Mus musculus. Pan troglodytes
Контакты
Лаборатория	Институт медицинских исследований им. Монаша. Кембриджский университет
Основное упоминание	Шамит А. Самараджива и др. (2009)
Дата выпуска	2008
Доступ
Веб-сайт	http://www.interferome.org

Интерфером - это онлайн-сайт биоинформатики база данных генов, регулируемых интерфероном (IRG). Эти гены, регулируемые интерфероном, также известны как гены, стимулированные интерфероном (ISG). База данных содержит информацию о регулируемых генах типа I (IFN альфа, бета), типа II (IFN гамма) и типа III (IFN лямбда) и регулярно обновляется. Он используется сообществом исследователей интерферона и цитокинов как инструмент анализа и информационный ресурс. Интерфероны были идентифицированы как противовирусные белки более 50 лет назад. Однако их участие в иммуномодуляции, пролиферации клеток, воспалении и других гомеостатических процессах с тех пор было идентифицировано. Эти цитокины используются в качестве терапевтических средств при многих заболеваниях, таких как хронические вирусные инфекции, рак и рассеянный склероз. Эти интерфероны регулируют транскрипцию примерно 2000 генов в зависимости от подтипа интерферона, дозы, типа клетки и стимула. Эта база данных генов, регулируемых интерфероном, представляет собой попытку интеграции информации из высокопроизводительных экспериментов и баз данных молекулярной биологии для получения детального понимания биологии интерферона.

• 1 Содержание
• 2 Инструменты
• 3 Управление интерферомом
• 4 Ссылки
• 5 Внешние ссылки

Интерфером содержит следующие наборы данных:

• Данные по экспрессии генов, регулируемых интерфероном, из Homo sapiens, Mus musculus и Pan troglodytes, полученные вручную из более чем 30 общедоступных и внутренних микрочипов и протеомные наборы данных.

Интерфером предлагает множество способов поиска и извлечения данных из базы данных:

• Идентифицировать сигнатуры регулируемых интерфероном генов в данных микрочипа;
• Анализ и аннотация Gene Ontology ;
• Нормальная тканевая экспрессия генов, регулируемых интерфероном;
• Регуляторный анализ генов, регулируемых интерфероном;
• BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) анализ и загрузка последовательности ортолога;

Интерфером управляется командой в Университете Монаша : Институт медицинских исследований Монаша и Кембриджский университет

• ИНТЕРФЕРОМ