Вспышка криптоспоридиоза в Милуоки в 1993 году была значительным распространением криптоспоридиоза простейших в Милуоки, штат Висконсин, и крупнейшая вспышка заболевания, передающегося через воду, за всю задокументированную историю США. Завод по очистке воды на Ховард-авеню (см. водонапорная башня Town of Lake ) был загрязнен, и уровень мутности очищенной воды был значительно выше нормы. Это была одна из двух водоочистных станций Милуоки. Первопричина эпидемии так и не была установлена официально; изначально предполагалось, что это вызвано генотипом крупного рогатого скота из-за стока с пастбищ. Также считалось, что тающий лед и тающий снег, переносящие Cryptosporidium, могли попасть на водоочистные сооружения через озеро Мичиган. MacKenzie et al. и CDC показал, что эта вспышка была вызвана ооцистами Cryptosporidium , которые прошли через систему фильтрации одной из городских водоочистных станций и возникли на выходе водоочистных сооружений в 2 милях вверх по течению в озере Мичиган.
Такое ненормальное состояние на водоочистной станции продолжалось с 23 марта по 8 апреля, после чего установка была остановлена. В течение примерно двух недель 403 000 из примерно 1,61 миллиона жителей области Милуоки (из которых 880 000 обслуживались неисправным лечебным учреждением) заболели желудочными спазмами, лихорадка, диарея и обезвоживание, вызванные возбудителем. Смертельные случаи были связаны с этой вспышкой, в основном среди пожилых людей и людей с ослабленным иммунитетом, таких как люди с СПИДом.