Малая нуклеолярная РНК SNORD64 | |
---|---|
Прогнозируемая вторичная структура и сохранение последовательности SNORD64 | |
Идентификаторы | |
Symbol | SNORD64 |
Alt. Символы | snoHBII-13 |
Rfam | RF00570 |
Другие данные | |
РНК тип | Ген ; мяРНК ; мяРНК ; C / D-box |
Домен (ы) | Eukaryota |
GO | 0006396 0005730 |
SO | 0000593 |
PDB структуры | PDBe |
SNORD64 (также известный как HBII-13 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в биогенезе (модификации) других малых ядерных РНК ( мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК находится в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным участком биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мяРНК) и также часто упоминается как направляющая РНК.
SNORD64 принадлежит к классу snoRNA C / D-бокса, которые содержат консервативные мотивы последовательностей, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства C / D-боксов управляют сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК.
snoRNA HBII-13 экспрессируется в основном в тканях мозг, но также находится в легких, почках и мышцах; однако HBII-13 не имеет идентифицированной целевой РНК. Ген HBII-13 расположен в интроне размером 460 т.п.н. большой отцовской экспрессии единицы транскрипции (SNURF-SNRNP -UBE3A AS) вместе с несколькими другими snoRNAs HBII-436, HBII-437, HBII-438A / B и кластеры HBII-85, HBII-52. Этот ген-хозяин представляет собой антисмысловой транскрипт материнского гена UBE3A.