РНК-полимераза IV представляет собой фермент, который синтезирует малую интерферирующую РНК (миРНК) в растениях. Полимераза IV специфична для геномов растений и необходима для синтеза более 90% 24-нуклеотидной гетерохроматической миРНК.
РНК-полимераза подавляет транспозоны и повторяющуюся ДНК в пути миРНК. SiRNA играет важную роль в защите генома от вторгающихся вирусов и мобильных элементов с помощью РНК-направленного метилирования ДНК.
Полимераза IV и деметилаза ROS1 разблокируют и повторно конденсируют 5S рДНК хроматин, который присутствует в семенах и используется для развития взрослых признаков у растений. Полимераза IV участвует в установлении паттернов метилирования генов 5S во время созревания растений.
Известно, что у арабидопсиса полимераза IV взаимодействует с РНК-зависимой РНК-полимеразой, RDR2 и совокупностью Считается, что активность Pol IV-RDR2 приводит к образованию коротких дцРНК, которые могут быть разделены на миРНК длиной 24 нт с помощью DCL3.