Гидрофилия - довольно необычная форма опыления, при которой пыльца распространяется с потоком воды, особенно в реках и ручьях. Гидрофильные виды делятся на две категории: (i) те, которые распространяют свою пыльцу на поверхности воды. например, мужские цветки или пыльцевые зерна валлиснерии выходят на поверхность воды, которые пассивно уносятся водными потоками; некоторые из них в конечном итоге достигают женского цветка. (ii) Те, которые распространяют его под поверхностью. например, водоросли, у которых женские цветы остаются погруженными в воду, а пыльцевые зерна выпускаются в воду.
Поверхностное опыление происходит чаще и, по-видимому, является переходной фазой между ветровым опылением и истинной гидрофилией. У них пыльца плавает на поверхности и достигает рыльц женских цветков, как у Hydrilla, Callitriche, Ruppia, Zostera, Elodea. У Валлиснерии мужские цветки отделяются и плавают на поверхности воды; таким образом пыльники соприкасаются с рыльцами женских цветков. Поверхностная гидрофильность наблюдалась у нескольких видов Potamogeton, а также у некоторых морских видов.
Виды, демонстрирующие истинную подводную гидрофильность, включают Najas, где пыльцевые зерна тяжелее воды, и опускающиеся вниз ловятся рыльцами очень простых женских цветов Posidonia australis или Zostera marina и Hydrilla.