Белок железо-сера с высоким потенциалом

редактировать
Белок железо-сера с высоким потенциалом
PDB 1hpi EBI.jpg Структура окисленного белка железо-сера с высоким потенциалом.
Идентификаторы
СимволHIPIP
Pfam PF01355
InterPro IPR000170
PROSITE PDOC00515
SCOPe 1hpi / SUPFAM
суперсемейство OPM 116
белок OPM 1hpi

Белки железо-сера с высоким потенциалом (HIPIP) представляют собой особый класс ферредоксинов с высоким окислительно-восстановительным потенциалом 4Fe-4S , который функционирует в анаэробный перенос электронов, который происходит у фотосинтезирующих бактерий и Paracoccus denitrificans. HiPIP - это небольшие белки, которые демонстрируют значительные различия в их последовательностях, размерах (от 63 до 85 аминокислот) и в их окислительно-восстановительных потенциалах. Как показано на следующем схематическом изображении, кластер железо-сера связан четырьмя консервативными остатками цистеина.

[кластер 4Fe-4S] | | | | xxxxxxxxxxxxxxxxxxxCxCxxxxxxxCxxxxxCxxxx
'C'
консервативный цистеин, участвующий в связывании железо-серного кластера.
Содержание
  • 1 [Fe 4S4] кластеров
  • 2 Синтетические аналоги
  • 3 Биохимические реакции
  • 4 Ссылки
  • 5 Внешние ссылки
  • 6 Дополнительная литература
[Fe 4S4] кластеры

Кластеры [Fe 4S4] являются многочисленными кофакторами металлопротеинов. Они участвуют в последовательностях переноса электрона. Ядро кластера [Fe 4S4] представляет собой куб с чередующимися вершинами Fe и S. Эти кластеры существуют в двух степенях окисления с небольшим структурным изменением. Известны два семейства кластеров [Fe 4S4]: семейство ферредоксина (Fd) и семейство высокопотенциальных белков железо-сульфур (HiPIP). И HiPIP, и Fd находятся в одном и том же состоянии покоя: [Fe 4S4], которое имеет одинаковые геометрические и спектральные характеристики. Различия возникают, когда дело доходит до их активного состояния: HiPIP образуется путем окисления до [Fe 4S4], а Fd образуется путем восстановления до [Fe 4S4].

[Fe 4 S 4] 3 + (для HiPIP) ⇌ окисление [Fe 4 S 4] 2 + (состояние покоя) ⇌ восстановление [Fe 4 S 4] + (для Fd) {\ displaystyle {\ ce {{ \ underset {(для \ HiPIP)} {[Fe4S4] ^ {3} +}} <=>[{\ ce {окисление}}] {\ underset {(в состоянии покоя)} {[Fe4S4] ^ {2} +}} <=>[{\ ce {сокращение}}] {\ underset {(для \ Fd)} {[Fe4S4] +}}}}}{\displaystyle {\ce {{\underset {(for\ HiPIP)}{[Fe4S4]^{3}+}}<=>[{\ ce {окисление}}] {\ underset {(отдых \ состояние)} {[Fe4S4] ^ {2} +}} <=>[{\ ce {сокращение}}] {\ underset {(для \ Fd)} {[Fe4S4] +}} }}}

Различное окисление состояния объясняются белками, которые объединены с кластером [Fe 4S4]. Анализ кристаллографических данных позволяет предположить, что HiPIP способен сохранять свое более высокое состояние окисления за счет образования меньшего количества водородных связей с водой. Характерная складка белков охватывает [ Fe 4S4] в гидрофобном ядре, способный образовывать только около пяти консервативных водородных связей с кластером. r лиганды от остова. Напротив, белок, связанный с Fd, позволяет этим кластерам контактировать с растворителем, что приводит к 8 взаимодействиям H-связывания белка. Белок связывает Fd через консервативную структуру CysXXCysXXCys (X означает любую аминокислоту). Кроме того, уникальная структура белка и диполярные взаимодействия пептида и межмолекулярной воды способствуют защите кластера [Fe 4S4] от атаки случайных внешних доноров электронов, что защищает себя от гидролиза.

Синтетические аналоги

Аналоги HiPIP могут быть синтезированы реакциями обмена лиганда [Fe 4S4{N (SiMe 3)2}4] с 4 эквивалентами тиолов (HSR) следующим образом:

[Fe 4S4{N (SiMe 3)2}4] + 4RSH → [Fe 4S4(SR) 4 ] + 4 HN (SiMe 3)2

Кластер-предшественник [Fe 4S4{ N (SiMe 3)2}4] может быть синтезирован путем однореакторной реакции FeCl 3, NaN (SiMe 3)2и NaSH. Синтез аналогов HiPIP может помочь людям понять факторы, вызывающие окислительно-восстановительный потенциал различных видов HiPIP.

Биохимические реакции

HiPIP принимают участие во многих окислительных реакциях у живых существ и особенно известны с фотосинтетическими анаэробными бактериями, такими как Chromatium и. HiPIP. периплазматические белки в фотосинтезирующих бактериях. Они играют роль переносчиков электронов в циклическом потоке электронов между фотосинтетическим реакционным центром и комплексом цитохрома bc 1. Другие вовлеченные реакции окисления HiPIP включают катализирующий Fe (II) окисление, являясь донором электронов для восстановления se и акцептор электронов для некоторых тиосульфатокисляющих ферментов.

Ссылки
Внешние ссылки
  • PDOC00515 - Высокопотенциальные железо-серные белки в PROSITE
Дополнительная литература
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR000170
Последняя правка сделана 2021-05-23 11:43:05
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте