Войти
| Первый выпуск | 2006 |
|---|---|
| Операционная система | Кросс-платформенный |
| Веб-сайт | www.euresist.org |
EuResist - международный проект, направленный на улучшение лечения пациентов с ВИЧ путем разработки компьютеризированной системы, которая может рекомендовать оптимальное лечение на основе клинических и геномных данных пациента.
Проект является частью структура Virtual Physiological Human, финансируемая Европейской комиссией. Все началось в 2006 году с образования консорциума из нескольких исследовательских институтов и больниц в Европе и Израиле. Консорциум выполнил свои обязательства перед Европейской комиссией ближе к концу 2008 года, когда система стала доступна онлайн. В результате основными партнерами была создана некоммерческая организация для поддержания и улучшения системы.
В 2009 году проект EuResist был назван лауреатом программы награждения Computerworld.
СПИД - это заболевание, вызываемое HIV ретровирусом, который постепенно снижает эффективность иммунной системы. система, приводящая к инфекциям и, в конечном итоге, смерти.
Существует более 30 различных препаратов для лечения пациентов с ВИЧ. Антиретровирусные препараты могут нарушить процесс репликации вируса, в результате чего его численность резко снизится. Хотя полностью искоренить вирус невозможно, в небольших количествах он безвреден. Обычно пациенту назначают комбинацию из трех или четырех препаратов, лечение, известное как высокоактивная антиретровирусная терапия, или ВААРТ. Основная причина, по которой такое лечение может потерпеть неудачу, - это развитие мутировавших цепей вируса, устойчивых к одному или нескольким предписанным лекарствам.
Таким образом, при выборе лечения для пациента важно назначить те препараты, к которым вирусные цепочки конкретного пациента наиболее чувствительны. Один из способов добиться этого - извлечь образцы вируса из крови пациента и проверить их на все возможные препараты. Поскольку этот процесс является длительным и дорогостоящим, были разработаны компьютеризированные системы для прогнозирования устойчивости вируса на основе его генотипа. Лечащий врач отбирает последовательности генотипов вируса из крови пациента и передает эти данные в компьютеризированную систему. Затем система дает рекомендации по лекарствам.
Такие системы имеют ограниченную точность в зависимости от объема данных, используемых для их создания, их качества и разнообразия математических моделей, используемых для фактического прогнозирования. До EuResist такие системы имели несколько общих характеристик, отрицательно влияющих на их точность:
EuResist стремился создать более точную систему прогнозирования лечения ВИЧ, собирая большую базу данных in vivo (клинические и геномные записи реальных способов лечения ВИЧ). пациенты и их последствия), и используя массив моделей прогнозирования вместо одной.
База данных была создана путем объединения локальных баз данных различных клиник по всей Европе. Эта база данных считается самой большой в мире. Для каждого пациента он включает в себя различные личные и демографические данные, такие как пол, возраст, страна происхождения, геномное секвенирование ВИЧ, обнаруженного в крови пациента, записи о назначенных лекарствах и изменения количества вируса в крови после этого. лечения.
Эти данные использовались для обучения массива моделей прогнозирования, созданных с использованием различных современных методов машинного обучения, среди которых байесовские сети, логистическая регрессия и другие.
Веб-интерфейс позволяет врачам указывать клинические и геномные данные пациентов. Эти данные отправляются в механизмы прогнозирования, а комбинированный ответ, который отображается врачу, включает в себя различные предлагаемые методы лечения и прогноз их воздействия на количество ВИЧ в крови.
Система EuResist была протестирована и сравнена с ее предшественниками, в нее были внесены исторические данные о пациентах, результаты лечения которых известны. Разработчики EuResist, проводившие этот тест, сообщили об улучшении производительности по сравнению с предыдущей современной системой.
EuResist начал свою деятельность в 2006 году как консорциум, финансируемый Европейским Союзом как часть структуры Virtual Physiological Human FP-6. Партнерами этого консорциума были:
Консорциум завершил свое обязательство перед Европейским Союзом в конце 2008 года, когда система EuResist стала доступной онлайн. Первые пять партнеров, упомянутых выше, продолжали формировать некоммерческая организация, которая обслуживает систему, расширяет базу данных новыми клиническими и геномными записями и соответствующим образом обновляет механизмы прогнозирования. По состоянию на середину 2010 года в систему EuResist отправлялось в среднем 600 запросов каждый квартал.
1 июня 2009 г. EuResist получил награду лауреата программы награждений Computerworld - глобальной программы, присуждаемой отдельным лицам и организациям, использующим информационные технологии в efit Society.
