Войти
 | |
 | |
| Основана | 1 октября 1997 г. |
|---|---|
| Область исследований | Биологические науки об окружающей среде |
| Директор | Дуглас Мэнс |
| Персонал | 150 |
| Пользователи | 500 в год |
| Патенты | 100 плюс |
| Инструменты | 150 плюс |
| Размер | 234000 квадратных футов |
| Публикации | 400 в год |
| Адрес | Тихоокеанская северо-западная национальная лаборатория. Ричленд, Вашингтон, США |
| Местоположение | 46 ° 20′55 ″ N 119 ° 16′42 ″ W / 46,34861 ° N 119,27833 ° W / 46,34861; -119.27833 Координаты : 46 ° 20′55 ″ N 119 ° 16′42 ″ W / 46,34861 ° N 119,27833 ° W / 46,34861; -119.27833 |
| Веб-сайт | www.emsl.pnnl.gov / emslweb / |
Лаборатория молекулярных наук об окружающей среде (EMSL, произносится как эм-зул) - это биологический центр в Тихоокеанской северо-западной национальной лаборатории в Ричленд, Вашингтон, США. Он эксплуатируется США. Министерство энергетики (DOE), которое финансирует и контролирует его исследования и операции.
Ученые и сотрудники EMSL проводят фундаментальные исследования, которые фокусируются на биологических, биогеохимических и физических принципах для прогнозирования процессы, происходящие в мельчайших молекулярных и контролируемых геномикой масштабах в окружающей среде Земли, изменяются в самых больших масштабах.
EMSL использует шесть интегрированных исследовательских платформ для получения важной информации для понимания и прогнозирования молекулярных функций биологических и экосистемных процессов.
Биолог готовит образец РНК, чтобы понять, как грибы бурой гнили разрушают древесину. Functional Omics объединяет транскриптомный, протеомный и метаболомный анализы, чтобы раскрыть биологические процессы в растительных, грибковых и микробных системах.
Изотопный и химический анализ отслеживает судьбу изотопов и анализирует химический состав биологических и экологических систем.
Молекулярная биовизуализация предоставляет изображения структуры и расположения белков и других биомолекул с наноразмерным пространственным и временным разрешением.
Biogeochemical Transformations исследует, как молекулярные взаимодействия на поверхности земли, воды и воздуха преобразуют и переносят питательные вещества и загрязнители в окружающей среде.
Cellular Dynamics обнаруживает молекулярные сигналы внутри и между клетками, когда они реагируют на окружающую среду и другие организмы.
Молекулярное фенотипирование растений исследует взаимодействие между генами и окружающей средой для понимания, прогнозирования и контроля свойств растений.
EMSL - это исследовательский центр, с помощью которого ученые со всего мира могут бесплатно подавать проектные предложения для доступа к экспертам и оборудованию лаборатории. Предложения проверяются в процессе конкурентной экспертной оценки, чтобы убедиться, что проект имеет научное влияние и соответствует миссии Департамента биологических и экологических исследований Министерства энергетики США.
Ученые, чьи предложения принимаются, называются пользователями EMSL. Типичные проекты исследования пользователей могут длиться от нескольких месяцев до нескольких лет. Пользователи EMSL не обязаны оставаться на месте на время своего проекта и могут посещать лабораторию при необходимости. Большая часть обработки и анализа образцов может выполняться удаленно.
Сообщество пользователей EMSL предоставляет руководству лаборатории рекомендации по научному направлению и эффективной работе через избранный комитет представителей.
Идея, которая станет EMSL, началась в 1985 году с доклада Национальной академии наук под названием «Возможности в химии». В отчете определены научные проблемы, связанные с энергетикой и окружающей средой, для решения которых необходимы фундаментальные исследования.
В ответ тогдашний директор PNNL Уильям Р. Уили и старшие менеджеры лаборатории предложили центр молекулярных наук, который объединит исследователей из физических наук и наук о жизни и теоретиков с опытом в области вычислений и моделирования молекулярных процессов.. Уайли задумал установку с передовым оборудованием для изучения химии на молекулярном уровне комплексным и совместным образом.
Базирующийся в Огайо Battelle Memorial Institute, который управляет PNNL для Министерства энергетики, одобрил финансирование в размере 8,5 миллионов долларов в течение четырех лет на строительство объекта; разрабатывать исследовательские программы; и получить оборудование, помещения, ученых и вспомогательный персонал.
Строительство началось в июле 1994 года и было завершено в августе 1997 года. EMSL открылась 1 октября 1997 года для полной эксплуатации.
В течение первых пяти лет существования EMSL лидеры наращивали потенциал, нанимали научное руководство и привлекали пользователей. Затем руководители расширили научный фокус, включив в него биологию, в частности, изучение встречающихся в природе микробов для очистки окружающей среды, альтернативных источников энергии и сокращения выбросов двуокиси углерода в атмосфере.
Программа первых пользователей EMSL была сосредоточена на исследованиях с участием одного исследователя, которые пересекали научные области и быстро охватывали более 1000 пользователей в год, представляющих каждый штат и несколько зарубежных стран.
В этот период EMSL сосредоточилась на двух грандиозных задачах: вопрос биогеохимии, касающийся фундаментального взаимодействия между микробами и минералами, и исследование, касающееся структуры и функции белков в клеточная мембрана. Работа над этими проблемами открыла перед научным сообществом новые возможности, в рамках исследовательских кампаний, направленных на то, чтобы сосредоточить команды на решении одной задачи.
В январе 2007 года EMSL отпраздновала свое первое постоянное расширение: фальшпол площадью почти 4000 квадратных футов в центре высокопроизводительных вычислительных операций для суперкомпьютера Chinook с производительностью 11,8 терафлоп, который тогда был пятым по быстродействию. система в мире. В апреле 2008 года EMSL посвятила выдающемуся пользователю Дж. Майку Уайту новый офисный модуль, в котором работает около 100 сотрудников и пользователей PNNL. В начале 2012 года EMSL открыла свое тихое крыло, в котором размещается набор сверхчувствительных микроскопов высокого разрешения и сканирующих инструментов.
Биолог изучает натуральные биопродукты с использованием традиционной генетики и синтетической биологии. В октябре 2010 года основной пакет программного обеспечения EMSL для вычислительной химии, NWChem, стал открытым исходным кодом, что позволило ученым-компьютерщикам всего мира внести свой вклад в его будущее развитие и сделать его доступным для большего числа исследователей и студентов. Согласно поисковому запросу Web of Science в марте 2020 года, код был процитирован более 3760 раз с 2010 года.
В июне 2013 года EMSL сняла с производства суперкомпьютер Chinook и приветствовала систему Cascade с производительностью 3,4 петафлопс.
EMSL отметила свое двадцатилетие в августе 2017 года, продемонстрировав программное обеспечение NWChem для вычислительной химии, а также достижения в области изучения недр и базового производства биотоплива. В мероприятии приняли участие научные лидеры, в том числе всемирно признанные ученые Том Даннинг, Стив Колсон и Джин Футрелл.
Сегодня EMSL фокусирует свои научные исследования в области функциональной и системной биологии, а также трансформаций и взаимодействий окружающей среды вместе с пользователями из различных научных сообществ. Эта наука стимулирует развитие технологий и вычислительных возможностей.
