Войти
| Алисия Ошлак | |
|---|---|
 | |
| Родилась | Алисия Йинема Кейт Нунгараи Ошлак. 1975 (возраст 44–45). Ролейстон, Перт, Западная Австралия. |
| Национальность | Австралиец |
| Alma mater | Университет Мельбурна (бакалавр, доктор философии) |
| Известен за | профилирование широкого генома |
| Награды | Медаль Рут Стивенс Гани (2011), Премия Миллениум (2015) |
| Научная карьера | |
| Поля | |
| Учреждения | |
| Диссертация | Центральная структура радиоквазаров (2002) |
| Веб-сайт | oshlacklab.com |
Алисия Йинема Кейт Нунгарай Ошлак - австралийский биоинформатик и соруководитель отдела вычислительной биологии в Онкологическом центре Питера МакКаллума в Мельбурне, Виктория, Австралия.. Она наиболее известна своей работой по разработке методов анализа данных транскриптома в качестве меры экспрессии гена. Она охарактеризовала роль экспрессии генов в эволюции человека путем сравнения людей, шимпанзе, орангутанов и макак-резус, и работает совместно в анализе данных для улучшения использования клинического секвенирования образцов РНК с помощью RNAseq для диагностики заболеваний человека.
Алисия Ошлак родилась в Ролейстоне, Перт, в 1975 году. В 1993 году она окончила колледж Варрнамбул, Виктория, Австралия. Она получила степень бакалавра наук (с отличием) (1994–98) в Мельбурнский университет по специальности физика. Она осталась в Мельбурнском университете, чтобы получить докторскую степень по астрофизике, которую она завершила по теме центральной структуры радиоквазаров (1999-2003).
Ошлак сменила карьеру, чтобы применить свои математические знания к генетике после перехода в Институт Уолтера и Элизы Холл, где она работала научным сотрудником (2003–07), а затем старшей научный сотрудник (2007–2011 гг.) отдела биоинформатики. Ошлак перешел в Детский научно-исследовательский институт Мердока в Мельбурне в 2011 году, чтобы занять пост руководителя отдела биоинформатики. В 2013 году она была назначена сопредседателем консультативной группы по геномике и биоинформатике для The Melbourne Genomics Health Alliance. В 2013 году она также входила в организационный комитет Beyond the Genome. В 2019 году Ошлак была назначена соруководителем отдела вычислительной биологии в Онкологический центр Питера МакКаллума.
Исследования Ошлака были сосредоточены на методах анализа экспрессии генома, в частности, на вычислительном и статистическом анализе транскриптома данные. Это включает в себя работу над методами коррекции фона для двухцветных микрочипов, нормализацию данных микроматрицы, сравнительный анализ данных RNAseq и нормализацию паттернов метилирования в данных чипов ДНК человека.
Методология Ошлака позволил беспристрастно анализировать уровни экспрессии генов между людьми и другими приматами. Ее работа по сравнению уровней экспрессии генов в тканях печени пяти особей четырех разных видов приматов: людей, шимпанзе, орангутангов и макак-резусов выявила быструю эволюцию факторов транскрипции у людей. Дальнейшая связанная с этим работа посвящена изучению изменений уровня экспрессии этого фактора во многих тканях человека. За эту работу Алисия Ошлак была награждена медалью Рут Гани за генетику человека Австралийской академии наук в 2011 году.
Ошлак разработал программный конвейер для выполнения анализа клинической степени данных секвенирования ДНК для диагностических целей. Эти инструменты в настоящее время используются для анализа данных секвенирования при диагностике кардиомиопатий в Службе клинической генетики штата Виктория. Она также разработала инструменты для анализа данных об опухолях, в частности, для выявления мутаций, вызванных перестройкой генома опухоли, приводящей к образованию онкогенных генов слияния.
Взгляды Ошлак на баланс между работой и личной жизнью в науке и сообщение того, что делают биоинформатики, широкой аудитории на вечеринках.
СМИ, связанные с Алисией Ошлак на Wikimedia Commons