Войти
значок Virtual Fly Brain Virtual Fly Brain или VFB - это интерактивный веб-инструмент, позволяющий нейробиологам подробно изучить нейроанатомия, трансген экспрессия и связанные фенотипы мозга Drosophila melanogaster. Пользователи могут просматривать стопки нарисованных трехмерных изображений мозга дрозофилы, выбирая любую плоскость сечения, которую они хотят, и нажимая на нарисованные области, чтобы найти определения имен, ссылки и синонимы для выбранной области. Для каждой области они могут выполнять запросы, чтобы найти нейроны, экспрессию трансгена и фенотипы. Для каждого найденного нейрона пользователи могут просматривать определения, ссылки и синонимы.
Virtual Fly Brain - это общий веб-сайт. приложение на основе, которое позволяет просматривать стеки трехмерных изображений и запрашивать базовую базу данных анатомии и выражений, которая поддерживается FlyBase. Проект Virtual Fly Brain выполняется исследователями из Кембриджского университета и Эдинбургского университета.
Virtual Fly Brain использует онтологическая модель анатомии дрозофилы, написанная в OWL2 и основанная на литературе по дрозофилам. Он содержит подробную информацию как о грубой нейроанатомии, так и о классах нейронов и взаимосвязях между ними. В основе каждого запроса нейроанатомии лежит запрос этой онтологии в OWL-DL.
. В запросах фенотипа и экспрессии используется большой объем данных экспрессии и фенотипа в FlyBase, аннотированных с использованием онтологии анатомии дрозофилы. Каждый запрос выражения или фенотипа начинается с запроса онтологии анатомии для терминов, подходящих для выбранной области. Выходные данные этого запроса затем используются в качестве входных данных для запроса базы данных FlyBase chado для выражения или фенотипа, аннотированного с использованием этих терминов.
Изображения в средстве просмотра передаются в виде серии плиток, покрывающих только видимую область в окне браузера. Плитки производятся из составного 3D-объекта Woolz, представляющего общую структуру и отдельные окрашенные области.
