Войти
Феномика - это систематическое исследование фенотипов. Таким образом, это трансдисциплинарная область исследований, которая включает биологию, науки о данных, инженерию и другие области. Феномика связана с измерением феноменов, где феном - это набор фенотипов (физических и биохимических признаков), которые могут быть произведены данным организмом в течение ходе развития и в ответ на генетические мутации и воздействия окружающей среды. Понятия феномики используются в функциональной геномике, фармацевтических исследованиях, метаболической инженерии, сельскохозяйственных исследованиях и все чаще в филогенетике.
Одна из основных областей усилий включает улучшение, как качественно, так и количественно, способности измерять явления.
В науках о растениях исследования феноменов проводятся как в полевых условиях, так и в контролируемой среде. Полевые феномены включают в себя измерение фенотипов, которые встречаются как в культурных, так и в естественных условиях, тогда как исследования феноменов контролируемой среды включают использование теплиц, камер для выращивания и других систем, позволяющих управлять условиями роста. Портал TERRA-REF в Марикопе, штат Аризона, представляет собой платформу, разработанную для измерения полевых фенотипов, а инициатива «От генома кукурузы к полям» является примером крупномасштабного проекта распределенных полевых феноменов, охватывающего многие среды и годы. Системы контролируемой среды включают Enviratron в Университете штата Айова, Зал выращивания растений, строящийся в IPK, и различные платформы LemnaTec в Центре науки о растениях Дональда Дэнфорта, Университете Небраски-Линкольн и в других местах.
Доступен стандарт с минимальной информацией об эксперименте по фенотипированию растений (MIAPPE), который используется многими исследователями, собирающими и систематизирующими данные о феномене растений. Существуют новые методы анализа, в том числе разнообразный набор программных пакетов для компьютерного зрения, доступных через PlantCV. Многие исследовательские группы сосредоточены на разработке систем с использованием Breeding API, стандартизированной спецификации API веб-службы RESTful для передачи данных о селекции растений.
Австралийский фонд феномена растений (APPF), инициатива правительства Австралии, разработал ряд новых инструментов для всестороннего и быстрого измерения фенотипов как в лаборатории, так и в полевых условиях. NAPPN ведет список предприятий по изучению растений в Северной Америке.
Международная сеть фенотипирования растений (IPPN) - это организация, которая стремится обеспечить обмен знаниями, информацией, и опыт во многих дисциплинах, связанных с феноменом растений, путем создания сети, объединяющей участников, операторов платформ, пользователей, исследовательские группы, разработчиков и политиков. Региональные партнеры включают Европейскую сеть фенотипирования растений (EPPN), Североамериканскую сеть фенотипирования растений (NAPPN) и другие.
Европейская исследовательская инфраструктура для фенотипирования растений, EMPHASIS, позволяет исследователям использовать оборудование, услуги и ресурсы для многомасштабного фенотипирования растений по всей Европе. EMPHASIS направлен на содействие будущей продовольственной безопасности и сельскохозяйственному бизнесу в меняющемся климате, позволяя ученым лучше понимать производительность растений и применять эти знания в практических целях.
