Феном

редактировать

A Феном - это набор всех фенотипов, выраженных ячейкой, ткань, орган, организм или виды.

Так же, как геном и протеом обозначают Феномен всех генов и белков организма представляет собой сумму его фенотипических признаков. Примерами фенотипических черт человека являются цвет кожи, цвет глаз, рост или конкретные личностные характеристики. Хотя в основе любого фенотипа любого организма лежит его генотип, на фенотипическое выражение могут влиять влияния окружающей среды, мутации и генетические вариации, такие как однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) или комбинация этих факторов.

Феномика - это изучение феномена и того, как он определяется, особенно когда он изучается в отношении набора всех генов (геномика ) или всех белков (протеомика ).

Содержание
  • 1 Происхождение и использование
  • 2 См. Также
  • 3 Ссылки
  • 4 Внешние ссылки
Происхождение и использование

Термин впервые был использован Дэвисом в 1949 году, «Здесь мы предлагаем название фен для совокупности экстрагенных, неавторепродуктивных частей клетки, цитоплазматических или ядерных. Феном будет материальной основой фенотипа, так же как геном является материальной основой генотипа. "

Хотя феномен используется уже много лет, различие между использованием феномена и фенотипа проблематично. Предлагаемое определение обоих терминов как «физическая совокупность всех характеристик организма или одной из его подсистем» было предложено Манером и Кэри в 1997 году, которые утверждали, что, хотя ученые склонны интуитивно использовать эти и связанные с ними термины в некоторой манере это не препятствует исследованию, термины не имеют четкого определения и использование терминов непоследовательно.

Некоторые варианты использования термина позволяют предположить, что феномен данного организма лучше всего понимать как своего рода матрицу данных представляющий физическое проявление фенотипа. Например, дискуссии, которые вел А. Варки среди тех, кто использовал этот термин до 2003 г., предложили следующее определение: «Объем информации, описывающий фенотипы организма под влиянием генетических факторов и факторов окружающей среды». Другая группа исследователей характеризует «человеческий феномен [как] многомерное пространство поиска с несколькими нейробиологическими уровнями, охватывающими протеом, клеточные системы (например, сигнальные пути), нейронные системы и когнитивные и поведенческие фенотипы».

Растение биологи начали изучать этот феномен при изучении физиологии растений.

В 2009 году исследовательская группа продемонстрировала возможность выявления ассоциаций генотип-фенотип с использованием электронных медицинских карт (EHR), связанных с ДНК биобанки. Они назвали этот метод исследованием ассоциации в масштабе всего феномена (PheWAS).

См. Также
Литература
  1. ^Дэвис Б.Д. (январь 1949 г.). «Выделение мутантов бактерий с недостаточностью биохимии с помощью пенициллина». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 35(1): 1–10. doi : 10.1073 / pnas.35.1.1. PMC 1062948. PMID 16588845.
  2. ^Лёффлер М., Братке Т., Паулюс У., Ли YQ, Поттен С.С. (май 1997 г.). «Клональность и жизненные циклы кишечных крипт объясняются зависимой от состояния стохастической моделью организации эпителиальных стволовых клеток». Журнал теоретической биологии. 186 (1): 41–54. doi : 10.1006 / jtbi.1996.0340. PMID 9176636.
  3. ^Варки А., Альтейде Т.К. (декабрь 2005 г.). «Сравнение геномов человека и шимпанзе: поиск иголок в стоге сена». Исследование генома. 15(12): 1746–58. doi : 10.1101 / gr.3737405. PMID 16339373.
  4. ^Siebner HR, Callicott JH, Sommer T., Mattay VS (ноябрь 2009 г.). «От генома к феномену и обратно: связь генов с функцией и структурой человеческого мозга с использованием генетически обоснованной нейровизуализации». Неврология. 164 (1): 1–6. doi : 10.1016 / j.neuroscience.2009.09.009. PMC 3013363. PMID 19751805.
  5. ^Фербанк, Роберт Т.; Тестировщик, Марк (декабрь 2011 г.). «Феномика - технологии для устранения узких мест фенотипирования». Тенденции в растениеводстве. 16 (12): 635–644. doi : 10.1016 / j.tplants.2011.09.005. ISSN 1878-4372. PMID 22074787.
  6. ^Денни, Джошуа К..; Ричи, Мэрилин Д.; Basford, Melissa A.; Шкив, Джилл М.; Бастараче, Лиза; Браун-Джентри, Кристин; Ван, Диди; Masys, Dan R.; Роден, Дэн М.; Кроуфорд, Дана К. (01.05.2010). «PheWAS: демонстрация возможности сканирования всего феномена для выявления ассоциаций ген-болезнь». Биоинформатика (Оксфорд, Англия). 26 (9): 1205–1210. doi : 10.1093 / bioinformatics / btq126. ISSN 1367-4811. PMC 2859132. PMID 20335276.
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-06-01 12:01:59
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте