A Феном - это набор всех фенотипов, выраженных ячейкой, ткань, орган, организм или виды.
Так же, как геном и протеом обозначают Феномен всех генов и белков организма представляет собой сумму его фенотипических признаков. Примерами фенотипических черт человека являются цвет кожи, цвет глаз, рост или конкретные личностные характеристики. Хотя в основе любого фенотипа любого организма лежит его генотип, на фенотипическое выражение могут влиять влияния окружающей среды, мутации и генетические вариации, такие как однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) или комбинация этих факторов.
Феномика - это изучение феномена и того, как он определяется, особенно когда он изучается в отношении набора всех генов (геномика ) или всех белков (протеомика ).
Термин впервые был использован Дэвисом в 1949 году, «Здесь мы предлагаем название фен для совокупности экстрагенных, неавторепродуктивных частей клетки, цитоплазматических или ядерных. Феном будет материальной основой фенотипа, так же как геном является материальной основой генотипа. "
Хотя феномен используется уже много лет, различие между использованием феномена и фенотипа проблематично. Предлагаемое определение обоих терминов как «физическая совокупность всех характеристик организма или одной из его подсистем» было предложено Манером и Кэри в 1997 году, которые утверждали, что, хотя ученые склонны интуитивно использовать эти и связанные с ними термины в некоторой манере это не препятствует исследованию, термины не имеют четкого определения и использование терминов непоследовательно.
Некоторые варианты использования термина позволяют предположить, что феномен данного организма лучше всего понимать как своего рода матрицу данных представляющий физическое проявление фенотипа. Например, дискуссии, которые вел А. Варки среди тех, кто использовал этот термин до 2003 г., предложили следующее определение: «Объем информации, описывающий фенотипы организма под влиянием генетических факторов и факторов окружающей среды». Другая группа исследователей характеризует «человеческий феномен [как] многомерное пространство поиска с несколькими нейробиологическими уровнями, охватывающими протеом, клеточные системы (например, сигнальные пути), нейронные системы и когнитивные и поведенческие фенотипы».
Растение биологи начали изучать этот феномен при изучении физиологии растений.
В 2009 году исследовательская группа продемонстрировала возможность выявления ассоциаций генотип-фенотип с использованием электронных медицинских карт (EHR), связанных с ДНК биобанки. Они назвали этот метод исследованием ассоциации в масштабе всего феномена (PheWAS).