MethBase

редактировать
MethBase
Database.png
Содержание
Описание База данных для данных о метилировании ДНК с единственным разрешением цитозина и связанных аннотаций.
Организмы Человек Шимпанзе Горилла Резус Макака Мышь Arabidopsis
Контакт
Лаборатория Эндрю Д. Смит
Первичное цитирование Цян Сонг и др. (2013)
Дата выхода 2013
Доступ
Формат данных Trackhub в браузере генома UCSC
Веб-сайт http://smithlabresearch.org/software/methbase/

MethBase - это база данных данных о метилировании ДНК, полученная на основе данных секвенирования следующего поколения. MethBase обеспечивает визуализацию общедоступных экспериментов по бисульфитному секвенированию и сокращенное представление экспериментов по бисульфитному секвенированию через браузер генома UCSC. Содержимое MethBase включает уровни метилирования одиночного CpG-сайта для каждого CpG-сайта в интересующем геноме, аннотацию областей гипометилирования, часто связанных с промоторами генов, и аннотацию аллель- специфического метилирования, связанного с геномным импринтингом.

Смотрите также
использованная литература
  1. ^ а б Сун, Цян; Decato Benjamin E; Хонг Элизабет; Чжоу Мэн; Fang Fang; Цюй Цзянхань; Гарвин Тайлер; Кесслер Майкл; Чжоу Цзюнь; Смит Эндрю Д. (декабрь 2013 г.). «Справочная база данных метиломов и конвейер анализа для облегчения интегративной и сравнительной эпигеномики». PLOS ONE. 8 (12): e81148. Bibcode : 2013PLoSO... 881148S. DOI : 10.1371 / journal.pone.0081148. PMC   3855694. PMID   24324667.
внешние ссылки
  • v
  • т
  • е
Последняя правка сделана 2024-01-02 08:37:32
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте