Содержание | |
---|---|
Описание | База данных для данных о метилировании ДНК с единственным разрешением цитозина и связанных аннотаций. |
Организмы | Человек Шимпанзе Горилла Резус Макака Мышь Arabidopsis |
Контакт | |
Лаборатория | Эндрю Д. Смит |
Первичное цитирование | Цян Сонг и др. (2013) |
Дата выхода | 2013 |
Доступ | |
Формат данных | Trackhub в браузере генома UCSC |
Веб-сайт | http://smithlabresearch.org/software/methbase/ |
MethBase - это база данных данных о метилировании ДНК, полученная на основе данных секвенирования следующего поколения. MethBase обеспечивает визуализацию общедоступных экспериментов по бисульфитному секвенированию и сокращенное представление экспериментов по бисульфитному секвенированию через браузер генома UCSC. Содержимое MethBase включает уровни метилирования одиночного CpG-сайта для каждого CpG-сайта в интересующем геноме, аннотацию областей гипометилирования, часто связанных с промоторами генов, и аннотацию аллель- специфического метилирования, связанного с геномным импринтингом.