Integron

редактировать

Интегроны - это генетические механизмы, которые позволяют бактериям быстро адаптироваться и развиваться за счет накопления и экспрессии новых генов. Эти гены встроены в специфическую генетическую структуру, называемую генной кассетой (термин, который в последнее время заменяется на интегронную кассету), которая обычно несет одну беспромоторную открытую рамку считывания (ORF) вместе с рекомбинацией. сайт (attC). Кассеты интегронов встраиваются в сайт attI платформы интегрона посредством реакций сайт-специфической рекомбинации, опосредованных интегразой.

Содержание

  • 1 Открытие
  • 2 Структура
    • 2.1 Кассеты генов
  • 3 Встречаемость
  • 4 Терминология
  • 5 Ссылки
  • 6 Дополнительная литература
  • 7 Внешние ссылки

Открытие

Интегроны были первоначально обнаружены на конъюгативных плазмидах благодаря их роли в устойчивости к антибиотикам. В самом деле, эти мобильные интегроны, как они теперь известны, могут нести множество кассет, содержащих гены, которые почти исключительно связаны с устойчивостью к антибиотикам. Дальнейшие исследования пришли к выводу, что интегроны являются хромосомными элементами, и что их мобилизация на плазмиды была стимулирована транспозонами и выбрана путем интенсивного использования антибиотиков. Функция большинства кассет, обнаруженных в хромосомных интегронах, остается неизвестной.

Структура

Интегрон минимально состоит из:

  • гена, кодирующего сайт-специфичную рекомбиназу : intI, принадлежащую интегразе семейство
  • проксимальный сайт рекомбинации : attI, который распознается интегразой и в который могут быть вставлены генные кассеты
  • промотор: Pc, который управляет транскрипцией кодируемые кассетами гены

Кассеты генов

Кроме того, интегрон обычно содержит одну или несколько кассет генов, которые были включены в него. Кассеты генов могут кодировать гены устойчивости к антибиотикам, хотя большинство генов в интегронах не охарактеризованы. Последовательность attC (также называемая 59-be) представляет собой повтор, который фланкирует кассеты и позволяет кассетам интегрироваться в сайт attI, вырезать и подвергать горизонтальный перенос генов.

Возникновение

Могут быть обнаружены интегроны как часть мобильных генетических элементов, таких как плазмиды и транспозоны. Интегроны также можно найти в хромосомах.

Терминология

Термин супер-интегрон впервые был применен в 1998 году (но без определения) к интегрону с длинным массивом кассет на маленькой хромосоме Холерный вибрион. С тех пор этот термин использовался для интегронов с различной длиной массива кассет или для интегронов на бактериальных хромосомах (по сравнению, например, с плазмидами). Использование термина «супер-интегрон» в настоящее время не рекомендуется, поскольку его значение неясно.

Ссылки

Дополнительная литература

Внешние ссылки

  • IntegronFinder - Инструмент для обнаружения интегронов в бактериальных геномах
  • INTEGRALL - База данных Integron

.

Последняя правка сделана 2021-05-24 03:56:07
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте