HLA-DQ7

редактировать
Иллюстрация HLA-DQ с пептидом в кармане связывания
главный комплекс гистосовместимости, класс II, DQ7
ГаплотипыDQA1 * 03: 02: DQB1 * 03:01 DQA1 * 03: 03: DQB1 * 03: 01 DQA1 * 04: 01: DQB1 * 03: 01 DQA1 * 05: 05: DQB1 * 03: 01 DQA1 * 06: 01: DQB1 * 03: 01
Структура (см. HLA-DQ )
Идентификаторыальфа 1 * 0302 * 0303 * 0401 * 0505 * 0601
Символ (ы) HLA-DQA1
EBI-HLA DQA1 * 0302
EBI-HLA DQA1 * 0303
EBI-HLA DQA1 * 0401
EBI-HLA DQA1 * 0505
EBI-HLA DQA1 * 0601
Идентификаторыbeta 1 * 0301 * 0304
Символ (ы) HLA-DQB1
EBI-HLA DQB1 * 0301
EBI- HLA DQB1 * 0304
Общие данные
Locus chr.6 6p21.31

HLA-DQ7 (DQ7 ) серотип HLA -DQ, который распознает общие продукты гена HLA DQB1 * 0301 и менее распространенные HLA DQB1 * 0304. DQ7 представляет собой форму «расщепленного антигена» из широкой группы антигенов DQ3, которая также содержит DQ8 и DQ9.

DQ7 связан гаплотипом с рядом генов DQA1 (альфа-цепь DQ), продуцирует в цис-гаплотипической форме большое количество изоформ DQ αβ. Эти альфа-цепи DQ также известны как образующие трансгаплотипические изомеры с другими HLA-DQ.

DQ7 связан со следующими генами альфа-цепей (DQA1 *)

  • 03 - * 0301, * 0302, * 0303
  • 0401
  • 0505
  • 0601
Содержание
  • 1 Серология
  • 2 Аллели
    • 2.1 DQB1 * 0301
    • 2.2 DQB1 * 0304
  • 3 гаплотипа
    • 3.1 DQ7.3
    • 3.2 DQ7.4
    • 3.3 DQ7.5
    • 3.4 DQ7.6
  • 4 Ссылки
Серология
Распознавание DQ3, DQ7, DQ8 и DQ9 некоторых DRB1 * и
DQB1 *DQ7DQ3DQ8Выборка
аллель%%%размер (N)
03018540112220
030440358111

Эффективность серотипирования . Эффективность серотипирования DQ7 в отношении DQB1 * 0301 достаточно хорошая, но все же приводит к некоторым ложноотрицательным результатам, для * 0304 эффективность типирования низкая, а перекрестная реакция с DQ8 относительно высока.

Аллели

DQB1 * 0301

DQB1 * 0301 - основной аллель DQ7. DQB1 * 0301, по-видимому, связан с волчаночным антикоагулянтом.

DQB1 * 0304

DQB1 * 0304 - минорный аллель DQ7

гаплотипы
HLA DQA1 * 03: DQB1 * 0301 частоты
частота
исх.Население(%)
Чукотка Чукчи (Сибирь)26,7
Эскимосы Чукотки (Сибирь)25,0
Коряки (NE Камчатка, Сибирь)19,1
Полигусские эвенки (Сибирь)11,4
Халх (Улан-Батор, Монголия)11,0
Негидаль (Сибирь)9,6
Кушунский Бурят (Сибирь)8,0
Тариалан Хотон (Монголия)7,8
Франция Цеф6,0
Россия Тува (2)6.0
Удегейс Гвайсуги (Сибирь)4.8
Иркутск Тофалар (Сибирь)4,7
Ульчи (Сибирь)4,1
Бельгийское население24,1
Англия европеоидное4,0
итальянское население 22,8
Россия Тува Тоджа2,3
Китай Урумчи Казак2,4
Суламай Кец (Сибирь)2.3
Россия Сибирь Нганасан Дудинка2.1
Северо-Запад Славянская Русь2,0
Япония Фукуока1.2
Япония (2)1.1

Гаплотипы DQ этого серотипа образуются между цис-хромосомными генами локуса DQA1. Сюда входят DQA1 * 0301, * 0302, * 0303, * 0401, * 0505, * 0601.

Существует довольно большая степень дисбаланса в отношении DQA1 * 0301, что позволяет предположить, что это один из самых старых и наиболее известных аллелей HLA DQB1 * в Евразии. Структура интрона DQB1 предполагает, что расщепление DQB1 * 0301 DQB1 * 0302 / * 0303 произошло до DQB1 * 0302 / * 0303, распределение * 03 в Африке предполагает, что рекомбинация DQA1 * 03: DQB1 * 0301 в первую очередь является результатом событий рекомбинации которые произошли в Африке. Недавнее исследование миастении в Хьюстоне подтвердило присутствие A * 0505: B * 0301 в Нигерии. Гаплотипы B1 * 0301 и A1 * 03 обнаруживаются с относительно высокой частотой в Юго-Восточной Азии и Австронезии, что также указывает на то, что они хорошо прижились в экзоафриканской популяции.

DQ7.3

Гаплотип DQ7.3 может быть сформирован с помощью DQA1 * 0301: DQB1 * 0301, DQA1 * 0302: DQB1 * 0301, DQA1 * 0303: DQB1 * 0301. На западе более распространен гаплотип DQA1 * 0303: DQB1 * 0301. Генные продукты всех 3 функционируют одинаково, и субъединицы взаимозаменяемы. В литературе более старые тесты ДНК распознают DQA1 * 0303 как DQA1 * 0302, а самые старые тесты ДНК распознают все три как DQA1 * 03 или DQA1 * 0301.

DQA1 * 0303: DQB1 * 0301 может быть вовлечен в нарколепсию. DQ7.3, по-видимому, связан с изъязвлениями полости рта и заболеваниями десен

DQ7.4

HLA DQA1 * 0401: DQB1 * 0301
freq
ref.Население(%)
Чукотка Чукчи (Сибирь)9,5
Гвайсуги Удэгейс (Сибирь)9,5
Эскимосы Чукотки (Сибирь)8,7
Полигусские эвенки (Сибирь)7,2
СВ Коряки (Камчатка)6,5
Камерун Саа4,4
Суламайские кеты (Сибирь)2,3
Гамбия1,4
Фукуока Япония1,2
Кавказские американцы0,3

DQA1 * 0401: DQB1 * 0301 (DQ7.4) Этот гаплотип встречается в Сибири, Африке, но также в небольших количествах в Западной Европе.

DQ7.5

HLA DQA1 * 0505 частоты
частота
ref.Население(%)
Ливан (оценка)40,0
Италия Рим29,6
Нидерланды (2)15,5
Тунис14,6
Англия (2)10,1
Южная Корея6,8
Конго Киншаса Банту4,4

DQA1 * 0505: DQB1 * 0301 (DQ7.5) был генотипирован как DQA1 * 0501: DQB1 * 0301 до тех пор, пока не было обнаружено, что существует вариант аминокислотной последовательности в предварительно обработанном продукте гена DQA1 * (кодируемый полипептидом прото-α-цепи DQA1 * 0505). После обработки эта прото-альфа идентична α-цепи, закодированной в DQA1 * 0501, после обработки. Почти 100% гаплотипов DQ7.5 несут аллель DQA1 * 0505. DR5-DQ7.5 распространен в Юго-Восточной Европе и Леванте, при этом DQ7.5 достигает частоты гаплотипа 40% в Ливане. Его высокий уровень, вероятно, не случаен, гаплотип, по-видимому, защищает от ювенильного диабета, который, по-видимому, более распространен среди людей, употребляющих злаки. Зерновые впервые были одомашнены в Ближнем и Ближний Восток более 10 000 лет назад и выбор может объяснить более высокие частоты DQ7.5. (См.: Triticeae )

Обработанная альфа-субъединица DQA1 * 0505 идентична субъединице DQA1 * 0501, но наблюдаются некоторые незначительные различия в ассоциации с аутоиммунным заболеванием, возможно, в результате сцепления генов DR и DQB1. DQA1 * 0505 может играть роль в целиакии при двух обстоятельствах. Во-первых, он может увеличивать риск, когда присутствует DQ2.5, хотя текущие исследования показывают, что он незначительно увеличивает риск по сравнению с DQB1 * 0202 в DQ2.5 цис. гаплотип. DQA1 * 0505, без DQ2, встречается в небольшом проценте случаев целиакии (без DQ2 или DQ8).

DQ7.5 также часто встречается в новом мире, но с типами DR, которые реже встречаются в старом мире. Аллель DQA1 * 05 не ясен в новом мире. DQB1 * 0301 может находиться в условиях текущего положительного отбора в человеческой популяции, по крайней мере, в областях, где DQ2.5 и DQ8 являются высокими, так как они придают устойчивость к диабету типа 1. Для гепатита B DQ7 ассоциируется с персистенцией, но для C DQ7 также связано с разрешением. DQA1 * 0505, DQB1 * 0301, по-видимому, увеличивают риск меланомы у населения Испании, однако это может быть связано с недавними мигрантами со светлой кожей. DQB1 * 0301 также ассоциирован с аллергическим грибковым синуситом, индуцированными папилломавирусом (ВПЧ) бородавками, ограниченным кожным системным склерозом у африканцев, и первичный склерозирующий холангит у жителей Южной Европы. DQB1 * 0301 также предрасполагает к нарколепсии. DQB1 * 0301 не играет роли в каком-либо часто встречающемся аутоиммунном заболевании, и его присутствие на Ближнем Востоке, а также снижение частоты глютеновой болезни и диабета 1 типа в этих регионах наводит на мысль, что он имеет положительный отбор в пост- мезолите. зерновые общества в Западной Евразии.

DQB1 * 0301, по-видимому, больше связан с ранним началом миастении у японцев, чем DQ8, а также был обнаружен, что вместе с DQB1 * 0304 он связан с китайским MG. DQ7 или связанные типы DR могут играть роль в ревматоидном артрите. При целиакии DQ7 (A * 0505/1) может опосредовать целиакию, если также присутствует HLA DQ2.2. HLA DQB1 * 0301 у турок связан с тимомой, но риск может быть связан с локусами HLA класса I.

DQ7.6

HLA DQA1 * 0601 частоты
частота
ref.Население(%)
Джокьякарта Java48,1
Кирибати37,9
Науру28,4
Город Харбин (Маньчжурия, Китай)12,8
Таиланд12,7
Южнокорейский (5)4,4
Китай Пекин и Сиань3,5
Япония3,0
Индия Бомбей1,7
Англия европеоидная0,6
Центральная Италия0,6
Алжир10,5
Камерун0,4 ​​

DQA1 * 0601: DQB1 * 0301 (DQ7.6) - глобально редкий гаплотип, однако он встречается с высокой частотой в южной части Тихого океана и вдоль западного края Тихого океана. DQB1 * 0301, по-видимому, однозначно связан с DQA1 * 0601. DQ7.6 положительно ассоциирован с астмой, малосуставным ювенильным артритом без антиядерных антител, DQ7.6 отрицательно связан (Защитный против) ювенильного диабета, болезней печени и селезенки при инфекции Schistosoma japonicum, туберкулезе легких.

Литература

Последняя правка сделана 2021-05-22 08:48:36
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте