Интрон группы III

Интрон группы III - это класс найденных интронов в генах мРНК хлоропластов эугленид протистов. Они имеют обычный dVI группы II типа с выпуклым аденозином, обтекаемым dI, отсутствием dII-dV и ослабленным консенсусом сайтов сплайсинга. Сплайсинг выполняется с помощью двух реакций переэтерификации с выпуклым аденозином dVI в качестве инициирующего нуклеофила ; интрон иссечен как лариат. О том, как они работают, известно немного, хотя была создана изолированная система трансформации хлоропластов.

• 1 Обнаружение и идентификация
• 2 Ссылки
• 3 См. Также
• 4 Внешние ссылки

В 1984 году Монтандон и Штутц сообщили о примерах интронов нового типа в хлоропласте Эвглены . В 1989 году Дэвид А. Кристофер и Ричард Б. Халлик нашли еще несколько примеров и предложили название «интроны группы III», чтобы идентифицировать этот новый класс со следующими характеристиками:

• интроны группы III намного короче других самосплайсинговых классы интронов, в диапазоне от 95 до 110 нуклеотидов среди тех, которые известны Кристоферу и Халлику и идентифицированы в хлоропластах. С другой стороны, Кристофер и Халлик заявили: «Напротив, наименьший интрон эвглены хлоропласта группы II... составляет 277 нуклеотидов».
• Их консервативные последовательности, проксимальные к сайтам сплайсинга, имеют сходны с интронами группы II, но имеют меньше консервативных положений.
• Они не отображаются в консервативной вторичной структуре интронов группы II. (Действительно, Кристофер и Халлик не смогли идентифицировать какие-либо консервативные элементы вторичной структуры среди интронов группы III.)
• Они обычно связаны с генами, участвующими в трансляции и транскрипции.
• Они очень A + Т рич.

В 1994 году открытие интрона группы III с длиной на порядок больше показало, что длина сама по себе не является определяющим фактором сплайсинга в интронах группы III.

Сплайсинг интронов группы III происходит посредством образования лариата и кольцевой РНК. Сходства между группой III и ядерными интронами включают консервативные 5'-граничные последовательности, образование лари, отсутствие внутренней структуры и способность использовать альтернативные границы сплайсинга.

• Twintron

• GO: 0000374 - Запись генной онтологии для сплайсинга интронов группы III