Войти
В генетике и особенно генной инженерии, картирование делеций - это метод, используемый для обнаружения мутации сайтов в гене.
Принцип картирования делеций включает скрещивание штамма, который имеет точечную мутацию в гене, с несколькими штаммами, каждый из которых несет в себе делецию в разные области одного и того же гена. Везде, где между двумя штаммами происходит рекомбинация с образованием гена (+) дикого типа (независимо от частоты), точечная мутация не может находиться в области делеции. Если рекомбинация не может произвести гены дикого типа, то разумно сделать вывод, что точечная мутация и делеция обнаруживаются на одном и том же участке ДНК.
. Этот пример должен продемонстрировать, как работает принцип:
Предположим, у вас есть ген X, который в форме (+) дикого типа может быть показан линейно следующим образом:
5 '------------ -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- --- 3 'ген X, +
Предположим, штамм организмов имеет точечную мутацию в гене (теперь называется ген X, -, чтобы обозначить, что он больше не является диким типом):
5 '---------------------------------------- ------------ИКС------------------------------------- ------------------------- 3 'ген X, -
Теперь предположим, что у вас есть два штамма организмов, каждый с делециями в ген X на разных сайтах, называемый del-1 и del-2, соответственно (пунктирная линия указывает сайт делеции):
5 '--- ---------------- (..............................................) -------------------------------- ---------------- 3 'del-1
5' --------------------- --------------------------------------- (............................................) --------- 3 'del -2
Поскольку точечная мутация находится внутри делеции del-1, между точечным мутантом и мутантом del-1 не будет рекомбинантов дикого типа (+). Однако при скрещивании точечного мутанта и мутанта del-2 может быть получен успешный рекомбинант дикого типа (+).
При генетической рекомбинации, если мутантный аллель в доноре находится в последовательности, соответствующей удаленному участку в реципиенте, то (+) рекомбинанты не будут получены (как в скрещивании с del-1). Чтобы исправить делецию путем рекомбинации, донор должен иметь последовательность ДНК дикого типа в области, соответствующей ДНК, удаленной в реципиенте (как в скрещивании с del-2). Другими словами, существует реальная возможность рекомбинации между точечным мутантом и del-2, в которой может быть получена длина ДНК, не содержащая ни точечной мутации, ни делеции, что указывает на то, что мутации в этих двух штаммах не могут быть в тот же регион.
Обратите внимание, что не все кроссоверы между точечным мутантом и del-2 будут давать (+) рекомбинанты; в этом случае только те события кроссовера, которые происходят между точечным мутантом и 5'-концом делеции, будут наследовать последовательность дикого типа.
