Войти
темный протеом определяется как белки без определенной трехмерной структуры. Он не может быть обнаружен или проанализирован с использованием гомологичного моделирования или аналитического количественного определения, поскольку молекулярная конформация неизвестна. Темные белки в основном состоят из неизвестных неизвестных
По оценкам, около 14% протеома архей и бактерий и до 44–54% протеома эукариот и вирусов являются темными. Происхождение этих темных белков неясно. Большая часть темного протеома имеет вирусное происхождение. Темные области белка являются темными из-за того, что они происходят от необычных организмов, у которых нет достаточного количества близких родственников в текущих базах данных белков, чтобы предоставить данные о белках для выравнивания последовательностей и определения структуры.
Темные белки не применимы к парадигме структура-функция, которой следуют все белки. Они преимущественно состоят из внутренне нарушенных белков (IDP), которые необходимы для определенных биологических функций, таких как сплайсинг, транскрипционная и посттрансляционная передача сигналов и передача сигналов через белковые сети. Эти процессы обычно выполняются внутриклеточно, однако темные белки чрезмерно представлены во внеклеточном матриксе и в эндоплазматическом ретикулуме. Темные белки ведут себя так же, как полимеры, и способны принимать многие, если не бесконечные формы конформации из-за адаптируемости полипептидной цепи. Это связано с отсутствием структуры, которая обеспечивает гибкость и маневренность, которая помогает в определенных рибосомных и клеточных процессах. Они также чрезмерно представлены в определенных секреторных тканях и внешней среде, что помогает клетке противостоять жесткой клеточной среде. Эта функция не ограничивается только сигнализацией и защитой, хотя полностью не изучена. «Темные белки - это в основном неизвестные неизвестные»
В настоящее время только вычислительные и аналитические методы, такие как инфракрасный (ИК), круговой дихроизм ( CR), масс-спектрометрия (MS), эксперимент с одной молекулой, широкоугольное рентгеновское рассеяние, малоугловое рентгеновское рассеяние, широкоугольное рентгеновское рассеяние (WAXS), ядерный магнитный резонанс (ЯМР) и гель-фильтрация. Совместная методология с методами рекомендуется, если при использовании одного метода отсутствуют определенные точки данных, дополнительный метод может помочь заполнить этот пробел.
