Войти
Крестообразная ДНК - это форма не-B ДНК, для которой требуется как минимум 6 нуклеотидная последовательность из инвертированных повторов для образования структуры, состоящей из стебля, ответвления точка и петля в форме креста, стабилизированные отрицательной сверхспирализацией ДНК. Были описаны два класса крестообразной ДНК; в сложенном и разложенном виде. Складчатые крестообразные структуры характеризуются образованием острых углов между соседними плечами и основной цепью ДНК. Развернутые крестообразные структуры имеют плоскую квадратную геометрию и четырехкратную симметрию, в которой два плеча крестообразной формы перпендикулярны друг другу. Образование крестообразных структур в линейной ДНК термодинамически невыгодно из-за возможности расщепления оснований в точках соединения и открытых областей в петлях. Крестообразная ДНК обнаруживается как у прокариот, так и у эукариот и играет роль в транскрипции ДНК, репарации двухцепочечной ДНК, транслокации ДНК и рекомбинации. Крестообразные структуры могут увеличивать геномную нестабильность и участвуют в формировании различных заболеваний, таких как рак.
Крестообразные структуры ДНК стабилизируются посредством суперспирализации, и их образование снижает стресс, вызванный сверхспирализацией ДНК. Крестовидные структуры блокируют распознавание промотора tet в pX РНК-полимеразой. Крестовидные структуры также могут нарушать стадию кинетического пути, что показано, когда гираза ингибируется новобиоцином. Крестообразные структуры регулируют инициацию транскрипции, такую как подавление транскрипции рХ. Затем репликация ДНК может быть подавлена крестообразными третичными структурами ДНК, образованными во время рекомбинации, которые могут быть изучены для лечения злокачественных новообразований. Рекомбинация также наблюдается в соединениях Холлидея, типе крестообразной структуры.
В бактериальных плазмидах, RuvA и RuvB репарация повреждение ДНК и участвуют в процесс рекомбинации узлов Холлидея. Эти белки также отвечают за регулирование миграции ветвей. Во время миграции ветвей комплекс RuvAB помогает инициировать рекомбинацию, когда он связывает и расстегивает соединение Холлидея, как ДНК-геликаза, а также когда комплекс соединения RuvAB / Холлидея расщепляется, когда RuvC связывается с ним.
Другой пример значимости крестообразной структуры проявляется во взаимодействии между р53, супрессором опухоли, и последовательностями, образующими крестообразную форму. Связывание р53 коррелирует с инвертированными повторяющимися последовательностями, такими как те, которые помогают формировать крестообразные структуры ДНК. При отрицательном сверхспиральном стрессе p53 связывается преимущественно с крестообразными мишенями из-за богатой A / T среды, которая имеет эти необходимые инвертированные повторяющиеся последовательности.
