Корабли служат в качестве флагманов командующего флотом . Они обеспечивают связь, офисные помещения и жилые помещения для командира флота и его штаба, а также служат для координации действий флота.
Вспомогательный командный корабль имеет компоненты управления и контроля, преобладающие на десантных кораблях (командование), а также имеет возможность высаживать войска и оборудование. Эти силы будут немного меньше, чем на чисто десантном корабле, из-за того, что корабль является командирским, и, следовательно, также будут содержать командующего штурмовиком, командующего флотилией или кого-либо с аналогичным статусом (обычно НАТО OF-7 или OF-8 ранг - например, генерал-майор или вице-адмирал ).
В настоящее время ВМС США эксплуатирует два командных корабля: USS Blue Ridge и USS Mount Whitney, оба специально построенные Класс Blue Ridge. USS La Salle был выведен из эксплуатации в марте 2005 года и затонул в качестве цели в поддержку учений флота 11 апреля 2007 года. USS Coronado был выведен из эксплуатации и затоплен в рамках учений с боевой стрельбой Valiant Shield 2012.
Советский Союз эксплуатировал несколько командных кораблей космической программы, Академик Сергей Королев, Космонавт Владимир Комаров, Космонавт Юрий Гагарин и советский корабль связи SSV-33 Урал. Эти корабли значительно увеличили дальность слежения, когда орбиты космонавтов и беспилотных полетов не находились в пределах досягаемости советских наземных станций слежения. Аналогичные корабли США включали Наблюдательный остров USNS.