Войти
.
| Содержание | |
|---|---|
| Описание | Целлозавр : ресурс знаний о линиях клеток |
| Типы данных. захвачено | Клеточные линии |
| Организмы | Позвоночные, Насекомые, Клещи |
| Связаться | |
| Исследовательский центр | Швейцарский институт биоинформатики |
| Лаборатория | КАЛИФО |
| Авторы | Амос Байрох |
| Доступ | |
| Формат данных | База данных плоских файлов, OBO и XML |
| Веб-сайт | Интернет.expasy.org / cellosaurus / |
| URL загрузки | ftp://ftp.expasy.org/databases/cellosaurus |
| Инструменты | |
| Интернет | Поиск |
| Разное | |
| Лицензия | Creative Commons Attribution-NoDerivs |
| Управление версиями | Да |
| Выпуск данных. Частота | От 4 до 6 выпусков в год |
| Политика курирования | Да - вручную |
| Закладки. сущностей | Да - отдельные записи клеточной линии |
Целлозавр - это онлайн-ресурс знаний о клеточных линиях, который пытается задокументировать все клеточные линии, используемые в биомедицинских исследованиях. Он предоставлен Швейцарским институтом биоинформатики (SIB) как один из его вкладов в ELIXIR. Это дополнительный ресурс для клеточных линий на портале идентификации ресурсов. По состоянию на апрель 2020 года он содержит информацию примерно о 118 000 клеточных линий.
В его объем входят иммортализованные клеточные линии, естественно бессмертные клеточные линии (например: эмбриональные стволовые клетки ) и клеточные линии с ограниченным сроком жизни, когда они распространяются и широко используются. Целлозавр предоставляет огромное количество информации, подобранной вручную; для каждой клеточной линии перечислено рекомендованное название, синонимы и вид происхождения. Другие типы информации включают стандартизированную терминологию заболевания (для линий клеток рака или генетического заболевания ), трансформант, используемый для бессмертия линии клеток, трансфицированные или нокаутированные гены, микросателлитная нестабильность, удвоение время, пол и возраст донора (пациента или животного), важные вариации последовательности, веб-ссылки, ссылки на публикации и перекрестные ссылки на более чем 70 различных баз данных, онтологий, коллекций клеток и других соответствующих ресурсов.
Поскольку многие линии клеток, использованные в исследованиях, были неправильно идентифицированы или загрязнены, целлозавр отслеживает проблемные клеточные линии, включая все те, которые перечислены в таблицах Международного комитета по аутентификации клеточных линий (ICLAC). Для линий клеток человека и некоторых собак он предоставляет информацию о профиле коротких тандемных повторов (STR). С июля 2018 года все клеточные линии целлозавра представлены в виде элементов в Викиданных. В марте 2020 года целлозавр создал страницу, содержащую информацию о клеточных линиях, относящуюся к SARS-CoV-2 в ответ на пандемию COVID-19.
