Амос Байрох | |
---|---|
Амос Байрох | |
Родился | (1957-11-22) 22 ноября 1957 (возраст 62) |
Alma mater | Женевский университет |
Известен | |
Awards |
|
Научная карьера | |
Области деятельности | |
Учреждения | Швейцарский институт биоинформатики |
Веб-сайт | web.expasy.org / groups / people / amos.html |
Амос Байрох (родился 22 ноября 1957 г.), швейцарский биоинформатик и профессор кафедры Биоинформатика на факультете наук о человеческом белке Женевского университета, где он возглавляет группу CALIPHO в Швейцарском институте биоинформатики (SIB), объединяющую биоинформатику, курирование, и экспериментальные попытки функционально охарактеризовать человеческие белки.
Его отец был экономическим историком Полом Байрохом.
Его первым проектом, как докторантом, была разработка PC / Gene, MS-DOS программный пакет для анализа белковых и нуклеотидных последовательностей. PC / Gene был коммерциализирован сначала швейцарской компанией (Genofit), затем Intelligenetics в США, которая позже была куплена Oxford Molecular.
Его основная работа находится в области белков. анализ последовательности и, в частности, при разработке баз данных и программных средств для этой цели. Его самый важный вклад - это ввод человеческих знаний путем тщательного ручного аннотирования данных, связанных с белками.
Во время работы над PC / Gene он начал разрабатывать аннотированную базу данных последовательностей белков, которая стала Swiss-Prot и впервые был выпущен в июле 1986 года. С 1988 года это был совместный проект с группой библиотеки данных Европейской лаборатории молекулярной биологии, которая позже превратилась в Европейский институт биоинформатики (EBI).
База данных Swiss-Prot является основным источником последовательностей белков в мире и является ключевым исследовательским инструментом как для специалистов по биоинформатике, так и для лабораторных ученых в очень широком диапазоне приложений. Показателем его успеха является недавняя разработка UniProt, самого полного в мире каталога информации о белках. UniProt - это центральный информационный ресурс последовательностей и функций белков, созданный путем объединения информации, содержащейся в Swiss-Prot, TrEMBL и американском Информационном ресурсе по белкам (PIR) базы данных.
В 1988 г. он начал разрабатывать PROSITE, базу данных семейств и доменов белков. Немного позже он создал ENZYME, номенклатурную базу данных по ферментам, а также SeqAnalRef, библиографическую справочную базу данных по анализу последовательностей.
В сотрудничестве с Роном Аппелем он инициировал в августе 1993 г. первый WWW-сервер молекулярной биологии, ExPASy. То, что задумывалось как прототип, быстро превратилось в крупный сайт, обеспечивающий доступ ко многим базам данных, частично или полностью созданных в Женеве, а также ко многим инструментам для анализа белков (протеомика).
В 1998 году вместе с коллегами из Женевы и Лозанны он был одним из основателей Швейцарского института биоинформатики SIB, чья миссия состоит в создании в Швейцарии центра передового опыта в области биоинформатики с упором на исследования, образование, услуги и разработка баз данных и инструментов.
В ноябре 1997 года вместе с Роном Аппелем и Денисом Хохштрассером он основал GeneBio (Geneva Bioinformatics SA), компанию, занимающуюся биологические знания. В апреле 2000 года указанные выше лица вместе с Кейт Роуз и Робин Оффорд основали GeneProt (Geneva Proteomics), высокопроизводительную протеомную компанию, которая прекратила свою деятельность в 2005 году.
С 2009 года в рамках группы CALIPHO, возглавляемой он сам и Лиди Лейн участвует в разработке neXtProt ресурса, цель которого - предоставить ученым-биологам широкий спектр знаний обо всех человеческих белках.
Он также участвует в разработке Cellosaurus ресурса знаний о клеточных линиях.
По данным Google Scholar и Scopus, по состоянию на 2015 год его самые цитируемые рецензированные статьи в научных журналах были опубликованы в Nucleic Acids Research, Biochemical Journal, Nature, Briefings in Bioinformatics и Database.
Байрох был лауреатом Премии Фридриха Мишера 1993 года от Швейцарского общества биохимии, поощрительной премии Фонда Гельмута Хортена в 1995 году, премии Пера Эдмана 2004 года, Европейской премии Лациса в 2004 году , премия Отто Нэгели 2010 года, премия HUPO за выдающиеся достижения в области протеомных наук 2011 года, награда пионера протеомики EUPA 2013 года, а в 2018 году награда ABRF Award.
По мере того, как процесс идет вниз, мы приближаемся к точке, где каждый геном, который можно секвенировать, будет секвенирован.